应用蛋白质组学方法筛选乳腺癌相关蛋白质

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1、分类号:学号:2009004//l丫l/I/Iz/Hl/14t//l/14/ll/l/。/lll/19llllH8IHll6/l//ll/泰山压亏弦硕士学位论文论文题目:应用蛋白质组学方法筛选乳腺癌相关蛋白质作者姓名:侯巍巍学科、专业:病理学与病理生理学。学位类型:科研学位型研究方向:肿瘤方向指导教师:侯刚教授入学时间:2010年9月论文工作起止时间:2011年10月~2013年2月目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.1英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。3符号

2、说明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯6前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯7再U磊⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯7第一部分⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.11乳腺浸润性导管癌与周围正常乳腺组织差异表达蛋白筛选材料与方法材料与方法⋯.⋯.⋯..⋯⋯.⋯.⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯...⋯.⋯⋯⋯⋯.⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯..】【:

3、!结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯23讨论⋯⋯。。⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。25第二部分⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.27乳腺浸润性导管癌与周围正常乳腺组织差异表达蛋白鉴定材料与方法材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯29结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯3l讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯38结论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.50附图⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.51参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯53综ji苤⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.59致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.69原创性声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯:⋯⋯⋯70应用蛋白质组学方法筛选乳腺癌相关蛋白质研究生:侯巍巍专业:病理学与病理生理学导师:侯刚教授中文摘要目的本实验运用双向凝胶电泳(twodimensionalgelelectrophoresis,2-DE)技术、质谱分析(massspectrometry,MS)技术以及生物学信息数据库搜索等方法,筛选乳腺癌组织与周围正常乳腺组织之间的差异蛋白,通过比较这些差异表达蛋白谱,寻找和鉴定与乳腺癌相关的蛋白质,深入了解这些蛋白质的结构和功能,筛选出与乳腺癌诊断及预后相关的特异性标志物并为进一步研究奠定基础。方法

6、选取新鲜乳腺浸润性导管癌组织及癌旁3.0cm以外的周围乳腺正常组织(经病理证实)30例进行双向凝胶电泳,得到的差异蛋白点用ImageMaster2DPlatinum5.0图像分析软件进行分析,显示蛋白点强度比值>2.0,说明蛋白点具有表达差异。运用基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱分析(matrixassistedlaserdesorptionionization—timeofflight-massspectrometry,MALDI—TOF.MS)对所筛选的差异蛋白点做质谱鉴定;根据检索软件Mascot计算得到蛋白的分值,分值达到70分以上认为这个蛋

7、白质鉴定可靠;将质谱分析得到的数据输入NCBI数据库来获得蛋白质的信息。结果利用ImageMaster2DPlatinum5.0凝胶图象分析软件对两样本总蛋白进行分析,寻找差异蛋白位点,得出结果:浸润性导管癌组织总共有l0404-l5个蛋白位点,癌旁正常乳腺组织共得到了1003+17个蛋白位点。根据ImageMaster2DPlatinum5.0凝胶图象分析系统分析后所得到的差异蛋白数据,从中选择差异在2倍以上的经肉眼确认的28个蛋白位点进行质谱分析,其中有22个蛋白点表达上调,6个蛋白点表达下调。最终有23个蛋白点得到鉴定(蛋白得分大于70分)。这

8、些蛋白大致分为:(1)S100钙连接蛋白:S100.A11;(2)分子伴侣:热休克蛋白27(HSP27)、热

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