胎儿基因组拷贝数变异研究及产前诊断流程的初步建立

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1、万方数据论文题目：脸』L基因组撞丛数变昱巫塞区亡煎途断逾猩的塑垄建童答辩委员会主席：奎全咽塾援答辩委员会成员：奎搓数援鲑整进熬拯论文答辩日期：2Q!垒151Z万方数据温州医科大学硕士学位论文目录

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3、IIIIIIIIIIIII111Y2692090中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．2Abstr&ct．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．6材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．10结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．19分析与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．28参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯34附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．39致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．40学位论文独创性声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．53关于学位论文使用授权声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．53万方数据温州医科大学硕士学位论文胎儿基因组拷贝数变异研究及产前诊断流程的初步建立中文摘要目的我国是出生缺陷大国，近几年实际出生缺陷发生率高至4-6％，环境因素、遗传因素、环境和遗传综合因素所致的基因组结构变异(Structuralvariation，sv)是造成出生缺陷的重要原因。本研究利用单核苷酸多态性微阵列

5、技术(singlenucleotidepolymorphismarray,SNParray)平台，研究胎儿基因拷贝数变异(copynumbervariations，CNVs)类型、分布及临床相关性，探索复杂病例致病机制，建立CNVs产前诊断实践流程，提供临床咨询理论依据。方法知情同意下，收集364例参加产前诊断孕妇的临床资料备用。B超下采集羊水168例，脐带196例标本送检，同步进行染色体培养及SNParray技术检测。SNP芯片包括30万个SNP探针，平均间隔为3lkb，CNVs结果根据隐马可夫模型(HiddenMarkovModel，HMM)推算。疑难CNV

6、S变异病例需要荧光定量PCR等技术验证，父母溯源性CNVs检测验证，综合分析后提供临床咨询依据。根据孟德尔遗传定律和实验结果探索2个复杂病例的发病机制。总结研究结果，建立SNParray临床产前诊断实践流程。结果1、CNVs分布和类型：364例孕妇胎儿sNP芯片检测结果发现了266个大于100kb的CNVs，其中25个为致病性，191个为正常多态性，50个为意义不明确(variantsofunknownsignificance，VOUS)的CNVs。重复型CNV为168个，缺失型为82个，杂合性缺失(Lossofheterozygosity，LOH)为l6个。2

7、、SNP芯片检测结果：364例标本中，检出异常25例，包括非整倍体3例，嵌合l例，致病性缺失19例，致病性重复2例。具体为18三体，2l三体，22q1l微缺失综合征、3q24缺失综合征、16q22缺失综合征、lq21缺失或重复综合征、Angelman综合征等，异常检出率为6．8％；在染色体核型正常病例中SNP芯片致病性CNVs检出率为5．2％；超声检查异常案例中SNP芯片异常检出率可以高达8．7％。3、根据孟德尔遗传定律，结合染色体核型结果，揭示l例复杂嵌合体发病机制及1例结果不一致的病例的发病机制。4、根据研究和实践，建立临床检测流程。结论CNVs与出生缺陷相

8、关，SNParray技术是检测CNvs的较好平台，比染色体核型检测平台异常检出率提高5．2％。SNParray技术结合传统核型分析，可以发现新的发病机制，丰富临床咨询理论。课题建立的SNP实践检测流程能推广临床应用。关键词：产前诊断；SNP微阵列技术；微小缺失或重复综合症；遗传咨询；基因2万方数据温州医科大学硕士学位论文拷贝数变异；染色体核型分析3万方数据温州医科大学硕士学位论文TheStudyofFetalCopyNumberVariationandtheInitialEstablishofPrenatalDiagnosisProcessAbstractobj

9、eetive：Chinahasbeensufferingfrombirthdefects．诵t11theoccurrenceincreasinghighupto4-6％．Environmentalelement，geneticbackgroundandthecombinedeffectarethemaincausesofbirthdefect．Thisstudyinvestigatestheclassification，distributionandclinicalrelevanceofcopynumbervariation(CNVs)offetusgenome

10、susingsingle