mirna及其靶标和转录因子的染色体定位及表达分析

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1、分类号密级华中农业大学硕士学位论文miRNA及其靶标和转录因子的染色体定位及表达分析GeneticmappingandexpressionanalysisofmiRNAsandtheirtargetgenesandtranscriptionfactorsincotton研究生：学号：指导教师：指导小组：专业：作物遗传育种申请学位：农学硕士陈学梅2010301110116林忠旭教授张献龙教授聂以春教授郭小平教授朱龙付副教授涂礼莉副教授研究方向：棉花遗传育种获得学位时间：2013年6月华中农业大学植物科学技术学院二。一三年

2、六月华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权书学位论文否如需保密，解密时间年月日是否保密独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得华中农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，指导教师对此进行了审定．与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明，并表示了谢意。研究生签名：洙孳桶时间：肋f弓年6月r日学位论文作者签名：豫簟秘导师签名：∥刃g乏乏叁之

3、窆少签名日期：功13年6月歹日签名日期：乃cj年6月歹日注：请将本表直接装订在学位论文的扉页和目录之间miRNA及其靶标和转录因子的染色体定位及表达分析目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯iAbstract．⋯．．⋯．⋯．⋯．．⋯．⋯．⋯⋯．．．⋯．⋯．．．．．．⋯．．．．⋯．．．．．．．．⋯．⋯．．．．⋯．⋯．．．．．．．．．．．．⋯．⋯．．．．．．．．．．．．．．iii缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．v第一章文献综述⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1microRNA简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．1．1miRNA的发现⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一21．1．2植物miRNA的生物合成途径⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．1-3miRNA的特点⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一41．1．4miRNA作用机理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一41．1．5植物miRNA的功能⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51．1．6miRNA及其靶标的检测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯一61．2转录因予简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71．2．1转录因子功能结构域⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71．2．2植物转录因子的研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯81．2．3转录因子的功能⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯81．3本研究的内容及目的意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯91．3．1研究内容⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯91．3．2研究的目的意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯9第二章miRNA及其靶基因的染色体定位及表达

6、分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯ll2．1材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．112．1．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．112．1．2miRNAs及靶基因的引物开发⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯ll2．1．3IIliRNA—Sm心技术可靠性的验证方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．132．1．4PCR扩增及电泳⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．132．1．5带型记录方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一132．1．6数据分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．1

7、42．1．7miRNAs及其靶标的RT．PCR和qRT．PCR分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯．142．1．8miRNAs与其靶标之间相互关系网络图的绘制方法⋯⋯⋯⋯⋯15华中农业大学2013届硕士研究生学位论文2．2结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．152．2．1序列挖掘及引物设计结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．152．2．2miRNA—SRAP标记技术的可靠性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．162．2．3遗传连锁图构建分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．162．2．4RT．PCR和qRT．PCR结果

8、分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．212．2．5miRNAs与其靶标在网络图上的分布规律分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯272．3讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．332．3．1miRNA及其靶标引物的开发策略⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．332-3．2miRNA在染色体上的均衡分布以及靶标的偏好分布⋯⋯⋯