德国镜鲤与黑龙江野鲤杂交组合的亲子鉴定及鲤鱼免疫功能基因snp位点研究

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101104上海海洋大学硕士学位论文德国镜鲤与黑龙江野鲤杂交组合的亲子鉴定及鲤题目：鱼免疫功能基因SNP位点研究ParentageIdentificationofHeilongjiangwildcarpandtheGermanmirrorcarpcrosscombinations英文题目：onMicrosatelliteDNAMarkersandCarpimmunefunctiongeneSNPresearch专业：水产养殖研究方向：遗传育种姓名：葛会争指导教师：石连玉二〇一二年五月十日上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明

2、：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海水产大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩

3、印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日上海海洋大学硕士学位论文上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名工作单位职称备注孙仲武东北林业大学教授主席梁利群黑龙江水产研究所研究员委员孙效文黑龙江水产研究所研究员委员张晓锋黑龙江水产研究所副研究员秘书答辩地点渔业工程研究所6楼答辩日期2012-5-25上海海洋大学硕士学位论文德国镜鲤与黑龙江野鲤杂交组合的亲子鉴定及鲤鱼免疫功能基因SNP位点研究摘要一、德国镜鲤与黑龙江野鲤杂交组合的亲子鉴定利用微卫星多态性进行鱼

4、类亲子鉴定，在鱼类选育中具有重要意义。本研究采用8个微卫星标记对黑龙江野鲤♀×德国镜鲤♂(正交组合)，及德国镜鲤♀×黑龙江野鲤♂(反交组合)进行亲子鉴定。结果显示：（1）正交组中父母本和子代观测杂合度分别为0.6071、0.7143和0.6818，多态信息含量依次为0.4421、0.2813和0.5535；反交组中父母本和子代观测杂合度分别为0.7083、0.5386和0.7438，多态信息含量依次为0.6735、0.3759和0.6241，表明8个位点具有较高的多态性。（2）正交组中，8个位点累计排除率为99.92%，亲本与子代的配对率98.00%（置信度为95%）

5、；反交组中，8个位点累计排除率为99.99%，亲本与子代的配对率99.00%（置信度为95%）。（3）关于使用微卫星标记数与鉴定率的探讨，对3、4、5、6、7、8个微卫星标记时的累计排除率和亲子配对率比较，结果表明，正反交组分别利用6和8个多态性良好的引物就能正确鉴定。二、鲤鱼免疫功能基因SNP位点的研究研究表明，11个鲤鱼免疫功能基因中有4个具有SNP。为此，做了进一步的SNP多态性研究。1.11个基因SSCP结果对TLR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、TLR9、I型IFN、TRAF6、IL-1β、MyD88a、MyD88b11个基因进行8个鲤鱼

6、群体292个个体SSCP检测。结果TLR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、I型IFN、TRAF6无SNP位点。IL-1β、TLR9、MyD88a、MyD88b基因多态性较高。2.IL-1β基因IL-1β基因在8个群体292个个体中共检测出13个变异位点，占整个片段长度的2.41%，其中3个为非同义突变。用NJ法进行8个群体的个体聚类，得出的结论是松浦镜鲤、松荷鲤及黑龙江野鲤大部分个体首先聚在一起，其次与松浦鲤，德国镜鲤成活组及德国镜鲤死亡组聚在一起，最后再与易捕鲤、大头鲤聚在一起。根据遗传距离的进行的种群聚类分析的结果与个体聚类分析的结果大致相同。I

7、上海海洋大学硕士学位论文3.TLR9基因TLR9基因在292个个体中共检测出37个变异位点，其中20个变异位点引起氨基酸的变化。c.988C>T、c.1237T>C、c.1700T>A、c.1770A>G、c.2278T>C、c.2307T>C、c.2377A>G、c.2547A>T、c.2580T>A、c.2646T>C在8个鲤鱼群体分布频率最高，其中c.2580T>A、c.2646T>C在8个鲤鱼群体中均有分布。4.MyD88a和MyD88b基因在MyD88a基因中共检测出6个变异位点，均位于第4内含子区域。在MyD88b基因共检测出9个变异位点