钝顶螺旋藻内与抗氧化胁迫相关的microrna-size srna的寻找及调控网络研究

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1、万方数据答辩委员会成员：翊堑堡越鏖垒烂垫监墨亟邋口N1堑：N生万方数据温州医科大学硕士学位论文目录缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯卜2中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯3—5英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯6—9前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯10—112目’J吕⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯lU—Z材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯13—251材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯132实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯14—252．1钝顶螺旋藻的培养和胁迫处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯142．2总RNA的提取和文库构建⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．3高通量测序及分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯162．4实时定量茎环PCR验证msRNA的表达⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯172．5钝顶螺旋藻组织总RNA的提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯202．6MsRNA的斑点杂交和Northernblotting验证⋯⋯⋯⋯⋯212．7靶基因的功能和信号通路分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯232．8靶基因的qRT—PCR鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯242．9MsRNA与靶基因的表达模式比较分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯25结果⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯261RNA样品及cDNA文库的质检⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯262测序数据的生物信息分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯283差异表达msRNA的实验验证⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯372万方数据温州医科大学硕士学位论文4MsRNA靶基因的预测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯405靶基因的GO和COG功能分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯426靶基因的KEGG代谢通路分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯437靶基因的GO和KEGG富集分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯438MsRNA作用靶基因的qRT—PCR验证⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯449MsRNA与靶

4、基因的表达模式比较⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯45分析与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯47—54参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯56—60附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61—71致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯72综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯73—78综述参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯79—81独创性申明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯82万方数据温州医科大学硕士学位论文缩略词表万方数据NCBInadDntnirAPchlidePCR温州

5、医科大学硕士学位论文NationalCenterforBi。tecIlIl。l。gyinfomati。n美国国家生物技术信息中心nicotinate—nucleotideadenylyltransferasenucleotide烟酰胺单核苷酸腺苷转移酶核苷酸ferredoxin--nitritereductase铁氧化蛋白亚硝酸还原酶Protochlorophyllide原叶绿素酸脂PolymeraseChainReactionLight-dependentPORProtochlorophyllideppsApsbDIIpstCqRT—PCRSODsRNAOxidoreducta

6、se聚合酶链反应光依赖的原叶绿素酸酯还原酶phosphoenolpyruvatesynthase磷酸烯醇丙酮酸合酶photosys‘emIIreac．ti。ncemerD2光合中心反应蛋白D2protempu‘a‘iVeph。sphateABctransp。rterABc转运蛋白磷酸酶permeaseprotemquantitativePolymeraseChainReactionsuperoxidedismutasesmallRNA定量聚合酶链反应超氧化物歧化酶小RNAS．platensisSpirulinaplatensis钝顶螺旋藻2万方数据温州医科大学硕士学位论文钝顶螺旋

7、藻内与抗氧化胁迫相关的microRNA．sizesRNA的寻找及调控网络研究中文摘要背景MicroRNA(miRNA)是真核生物中发现的一种内源性非编码小RNA，通过转录后调控靶基因的表达，对动、植物的生长，发育以及外界环境的胁迫应答都具有非常重要的调控作用。最近，在原核细菌中也有发现长度与miRNA大小相似的小RNA(microRNA．sizesmallRNA，msRNA)，同样可以转录后调控mRNA的表达来调节其生理过程。钝顶螺旋藻是一种光合自养的丝状原核蓝细菌，J’。泛分布