基于svm的基因表达谱分析和函数集vc维研究

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1、201l届硕士研究生学位论文学校代号：10269学号：51080601071葶震师为天擎基于SVM的基因表达谱分析和函数．集VC维研究院系：理工学院数学系专业名称：运筹学与控制论研究方向：模式识别与数据挖掘指导教师：硕士研究生：二零一一年五月一套一一=中n月DissertationofMaster201llIIIIIIIIIII11111111IY1905022SchoolCode：10269StudentNumber：5108060107lEastChinaNormalUniversityAnalysisofGe

2、neExpressionProfileBasedonSVMandResearchonFunctionDepartment：Major：Subject：Supervisor：Sets’VCDimensionDepartmentofMathematicsOperationalResearchandCyberneticsPatternRecognitionandDataMiningFuyongWan(AssociateProfessor)MasterCandidate：JieGao2011．5究》华东师范大学学位论文原创

3、性声明SVM的基因表达谱分析和函数集VC维研勾选)学位期间，在导师的指导下进行的研究工作及取得的研究成果．除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含其他个人已经发表或撰写过的研究成果．对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均己在文中作了明确说明并表示谢意．作者签名：——≤址日期：彦叫7年歹月万日华东师范大学学位论文著作权使用声明《基于读学位期间集VC维研究》系本人在华东师范大学攻请勾选)学位论文，本论文的研究成果归华东师范大学所有．本人同意华东师范大学根据相关规定保留和使用此学位论文，并向主管部门和相关机构如国家图书

4、馆、中信所和“知网”送交学位论文的印刷版和电子版；允许学位论文进入华东师范大学图书馆及数据库被查阅、借阅；同意学校将学位论文加入全国博士、硕士学位论文共建单位数据库进行检索，将学位论文的标题和摘要汇编出版，采用影印、缩印或者其它方式合理复制学位论文．本学位论文属于(请勾选)()1．经华东师范大学相关部门审查核定的“内部”或“涉密”学位论文’，于年月日解密，解密后适用上述授权．(√)2．不保密，适导师签名：本人签名：鑫i釜舢t1年岁只巧日·“涉密”学位论文应是已经华东师范大学学位评定委员会办公室或保密委员会审定过的学

5、位论文(需附获批的《华东师范大学研究生申请学位论文“涉密”审批表》方为有效)，未经上述部门审定的学位论文均为公开学位论文．此声明栏不填写的，默认为公开学位论文，均适用上述授权．硕士学位论文答辩委员会成员名单姓名职称单位备注詹兴致教授华东师范大学数学系主席王新伟副教授华东师范大学计算机系潘仁良副教授华东师范大学数学系华东师范大学基于SVM的基因表达谱分析和函数集VC维研究摘要癌症是影响人类健康的主要疾病之一，有着极高的死亡率，对癌症的预防和治疗已成为全球科学家关注的焦点．研究表明。癌症是一类复杂的基因疾病，因此研究癌

6、症基因表达谱、选取信息基因是我们寻找癌症相关基因、发现癌症基因表达特征的直接手段．本文第一部分主要针对基因表达谱数据维数高而样本少、噪声冗余而信息基因少的特点。首先利用离散度分析对结肠癌基因表达谱数据集进行特征的筛选．其次通过对基因之间相关性的分析，设计出向量分类算法，进一步提取特征基因，使得用于分类的基因数目进一步缩小．最后，分别利用支持向量机分类方法和势函数分类方法在上述特征提取的基础上对结肠癌数据集进行分类．通过对分类结果正确率与分类所用时间的统计，可以看到支持向量机方法对于结肠癌数据集的分类具有较好的效果．

7、文章第二部分对函数集VC维这一描述学习机器复杂性的重要概念进行探讨，对于n维空间中性指示函数集合的VC维是刀+l这一结论，本文在文献【1，2】的基础上对证明方法进行了改进，给出了一个完整的更具一般性的代数方法的证明．关键词：支持向量机；基因表达谱；特征选择；核函数；VC维．I华东师范大学基于SVM的基因表达谱分析和函数集VC维研究ABSTRACTCanceristhemajordiseasesaffectinghumanhealthandithasahighmortality．Preven_tionandtreat

8、mentofcancerhasbecomethefocusofscientistsaroundtheworld．Researchshowsthatcancerisacomplexgeneticdisease，SOthestudyofcancergeneexpressionprofileandselecttheinformativegenesa北thedire