盐地碱蓬(suaeda salsa)est数据库的构建及基因序列分析

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1、山东师范大学硕士学位论文盐地碱蓬(Suaedasalsa)EST数据库的构建及基因序列分析姓名：张磊申请学位级别：硕士专业：发育生物学指导教师：赵彦修2001.3.25盐IL碱蓬(Suoednanlso)GSl数P库的构建及),lIM)i列分析盐地碱蓬(Suaedasalsa)EST数据库的构建及基因序列分析摘要(L4的、:化严重影响着农、I。的，吞。。人们为提高植物刘渗透胁迫的耐受能力做了很多l_作，但以往的研究均受到耐逆反应遗传复杂性的制约。搜集耐逆模式植物的EST(expressedseque

2、ncetags表达序列标记)数据对J几发现与胁迫耐受相关的新华Ili来说，是一种相对快捷和节约的途、、飞圣汀欲地碱蓬(Suaedasalsa)可以耐受高缺胁迫它是一种非常好的研究植物耐缺机理的真AIL植物。木实验构建了一个经过400mMNaCl处理的故地碱蓬的cDNA文库，夕卜从‘}，随机挑选克隆单向测序。得到的EST共1000个，其[P773个与己知基因相似Al关信息均公布在GenBank的dbEST中。数据库经过各种软件分析，发现了很多与耐盐相关的基因和新的蛋白编码框。相信这些EST数据以及相关

3、的信息可以作为科学家研究植物耐逆机理的宝贵资源。关键词:耐逆模式植城EST,cDNA文韶真盐生植物，hlJA澎GenBank山东师范大学硕士论文419TMA(Snnedo.snlsa)EST数#01FW)构it"Oklkl序列分析ConstructionofESTDatabasefromaNaCl-TreatedSuaedasalsacDNALibraryandAnalysisofGeneSequencesAbstractAgriculturalproductivityisseverelyaffec

4、tedbysoilsalinity.Pasteffortstoimproveplanttolerancetoosmoticstresshavehadlimitedsuccessowingtothegeneticcomplexityofstressresponses.EST(expressedsequencetags)dataaccumulationfromstress-tolerantmodelsisarelativelyrapidandcheapwayfordiscoveringnewgenesr

5、elatedtoosmoticstress.Suaedasalsa,whichcantoleratehighsalinity,isafavoriteeuhalophyticmodelforsalinitytolerantresearch.WedisplayheretheconstructionofaNaCl-treatedcDNAlibraryandsingle-passsequencingofrandomlyselectedclones.EST(total1000,773ofwhichhavesi

6、milaritytoknowngenes)weregeneratedandsubmittedtodbESTinGenBank.Analysedwithsoftwares,manygenesrelatedtosalinitystresstoleranceandnewgeneswerefoundinourdbEST.ItisbelievedthatourdbESTandtheassociatedDNAmaterialswillbeaapplicablesourcetoscientistsengaging

7、instress-tolerancestudy.Keywords:stress-tolerantmodels,EST,cDNAlibrary,euhalophytic,Suaedasalsa,GenBank山东师范大学硕士论文欲地碱蓬(Saaedasalsa)ES"f数据库(I勺构建及4.1x1If列分析第一部分:文献综述科学研究迎来了一个崭新的时代，各种新的实验手段成为可能，观察、分析和发现的能力都达到以往无法比拟的水平。生物学研究也正处在巨人的转变之中，推动这一转变的是两个基本因子:DNA序列信

8、息的人量增加和用来开发这些信息的各种技术的不断发展[111,进入90年代以来，随养基因M研究的迅猛推进，藻因组的研究也发展迅速。如今己完成30余种生物的全基因组测序，其中包括多种细菌以及一些真核生物如酵母、线虫、果蝇等川，两种巨人的真核生物基因组一一人类基因组和拟南芥基因组也在新11i纪来临之前完成[a,at，这两个世纪宝宝的诞生充分展示了人规模基因组N1序的可行性和应}!』价值。除此之外，还有100多种生物的基fk]组测序}_作i1.在进行之‘】，(见鱼iv当w”w