盅口属和冠环属线虫的分类与亲缘关系分析

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1、entirelycongruentwiththecurrentmorphologicalclassification，itspurportsthecloserrelationshipbetweenKEYWORDS：Cyathostomum，Coronoc弦lus，rDNA-ITS，mtDNA-coxl，phylogenyV目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．IABSTRACT⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯III目录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯vii1引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．1圆线虫概述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．21．1．1圆线虫的分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．21．1．2圆线虫的危害⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．21．1．3圆线虫的生活史⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．31．1．3圆线虫的防治⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．31．2扫描电镜技术在线虫分类研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．41．2．1扫描电镜在生物学上的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51．2．2扫描电镜在线虫分类上的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．51．3分子标记技术在线虫分类鉴定中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．61．3．1rDNA．ITS分子标记在线虫研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯．．71．3．2线粒体DNA(mtDNA)分子标记在线虫研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯101．4本研究的内容及意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．132材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．152．1．1虫体标本采集与处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．1．2主要试剂及设备⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯152．2实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．192．2．1形态学初步分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．192．2．2虫体的扫描电镜观察⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．2．3基因

4、组DNA的提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯202．2．4PCR扩增及产物鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯202．2．5PCR产物纯化和测序⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2lV¨2．2．6测序结果的分析比对⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯213结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯233．1扫描电镜观察结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯233．1．1冠状冠环线虫⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯233．1．2大唇片冠环线虫⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．233．1．3小唇片冠环线虫⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．243．2rDNA．ITS序列测定及系统发育分析结果

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．283．2．1rDNA．ITS序列扩增结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯283．2．2rDNA．ITS序列分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．293．2．3盅口属线虫与冠环属线虫ITSI+ITS2序列遗传距离分析⋯⋯⋯⋯．．313．2．4基于ITS序列的系统发育分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．323．3peoxl序列测定及系统发育分析结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．353．3．1pcoxl序列扩增结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯353．3．2peoxl序列分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．353．3．2pcoxl序列遗传距离分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．3

6、63．3．3基于peoxl序列的系统发育分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．374讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯415结论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯47参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．49攻读学位期间发表的学术论文目录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯57致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．59独创性声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．61关于论文使用授权的说明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．611引言线虫(Nematoda)隶属于线虫动物门，是一类广布性无脊椎动物，除昆虫外动物界中最大的动物群体，有学者估计全部

7、种类约50．100万种以上。线虫不仅种类多，而且生活史复杂，生活类型多样，具有非常大的生物多样性。线虫的分布随处可见：淡水、海水、陆地，甚至分布在寒冷的南北极。线虫呈圆柱形，假体腔(充满体腔液，与外界不连通，称之为流体骨骼)，两侧对称，头尾两端渐细，头端钝圆，体表被角质层，通常雌雄异体，雄虫体型较雌虫小且雄虫尾端有区别于雌虫的交合伞结构，雌虫尾部有阴门，不同种类线虫体长大小不一。按生活类型划分，可分为自由生活类型和寄生生活类型。营寄生生活的线虫主要寄生在人和动植物的器