scge法检测dna损伤(包括dna单链断裂和dna交联)

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1、SCGE法检测DNA损伤SCGE的原理(中性电泳液,高盐和变性剂检测双链断裂;碱性检测单链,双链断裂和碱不稳定性)SCGE技术是一种在单细胞水平上检测有核细胞DNA损伤和修复的方法。该技术的原理是基于有核细胞的DNA分子量很大,DNA超螺旋结构附着在核基质中,用琼脂糖凝胶将细胞包埋在载玻片上,在细胞裂解液作用下,细胞膜、核膜及其它生物膜破坏,使细胞内的RNA、蛋白质及其它成分进入凝胶,继而扩散到裂解液中,唯独核DNA仍保持缠绕的环区(Loop)附着在剩余的核骨架上,并留在原位。如果细胞未受损伤,电泳中核DNA因其分

2、子量大停留在核基质中,经荧光染色后呈现圆形的荧光团,无拖尾现象。若细胞受损,在中性电泳液(pH8)中,核DNA仍保持双螺旋结构,偶有单链断裂(SSBs)并不影响DNA双螺旋大分子的连续性。只有当DNA双链断裂(DSBs)时,其断片进入凝胶中,电泳时断片向阳极迁移,形成荧光拖尾现象,形似彗星。如果在碱性电泳液(pH>13)中,先是DNA双链解螺旋且碱变性为单链,单链断裂的碎片分子量小即可进入凝胶中,在电泳时断链或碎片离开核DNA向阳极迁移,形成拖尾。细胞核DNA受损愈重,产生的断链或碱易变性断片就愈多,其断链或断片也

3、就愈小,在电场作用下迁移的DNA量多,迁移的距离长,表现为尾长增加和尾部荧光强度增强。因此,通过测定DNA迁移部分的光密度或迁移长度就可定量测定单个细胞DNA损伤程度。1.仪器及试剂冰箱,载玻片,水平电泳槽,荧光显微镜。不含Ca2+、Mg2+的PBS(PH=7.4);正常溶点琼脂糖(NMA)及低溶点琼脂糖(LMA)(0.6%溶于PBS);细胞裂解液(2.5MNaCl,100mMNa2EDTA,10mMTris-HCl,1%肌氨酸钠,PH=10,用前加1%TritonX-100,10%二甲亚砜(DMSO));电泳缓冲

4、液(0.3MNaOH,1mMNa2EDTA,PH=13);0.4MTris-HCl(PH=7.5);无水乙醇;20-30μg/mL溴化乙锭(EB)。2.方法1.在体外实验中,将对数期生长的细胞用0.25%胰蛋白酶消化,收集细胞备用。在体内实验中,取需测试的脏器或组织,用磷酸缓冲液(PBS,PH7.4)洗净后,剪至糜状滴加PBS(PH7.4)研磨,过300目筛子,收集细胞,悬浮于PBS(PH7.4)中,细胞密度为(1-5)x104-6个/mL(血细胞计数板最中央每小格0.5个细胞),台盼蓝染色、镜检、细胞存活率90%

5、以上,即可进行以下操作。2.样品处理:1)通过尾动脉取血,肝素或枸椽酸钠抗凝,800r/min离心5min,加等体积无钙镁磷酸缓冲液,获得细胞悬液。a.枸椽酸钠抗凝:有2Na3C6H5O7。和2Na3C6H5·11H2O等多种晶体。通常用前者配成109mmol/l(32g/l)水溶液(也有用106mmol/l浓度),与血液按1:9或1:4比例使用。枸椽钠对凝血V因子有较好的保护作用。b.肝素(heparin)每毫升血液抗凝需要持素15±2.5Iu.c.EDTA盐经1000C烘干,抗凝作用不变,通常配成15g/L水溶

6、液,每瓶0.4ml,干燥后可抗凝5ml血液。EDTA盐对红、白细胞形态影响很小.2)过氧化氢处理:细胞悬液分成两份:A份1ml;B份0.9ml。B份里再加0.1ml5mmol的过氧化氢,混匀。全部冰浴1小时。完后检测细胞存活率(台盼蓝染色、镜检)(过氧化氢处理用于检测DNA交联)。3)应用细胞悬液制备:4度下,1000r/min离心5分钟。去上清,加PBS(PH7.4)。每份制作2片凝胶。3.制胶将载玻片用砂纸(粒度No.380)磨出痕迹,以便凝胶附着.将37C正常溶点0.6%琼脂糖液(溶于不含Ca2+、Mg2+的

7、PBS,需要沸水加热)75-100μl铺展到预热的磨痕载玻片上,作为第一层凝胶,盖上盖玻片4℃凝固10分钟以上,去掉盖玻片后加入制备的细胞悬液85μl(10μl含1000个细胞的PBS和75μl0.6%的低熔点琼脂糖(LMA)在37℃混匀)铺展到载玻片上作为第二层,4℃至少10分钟,凝固后再铺展低溶点0.6%琼脂糖100μl作为第三层,使载玻片上琼脂糖呈“三夹层”式.(注意:NMA适宜浓度0.5%~1%,过高或过低将造成凝固速度过快而不易铺平或粘着力低而脱落,铺胶前载玻片预热,有利于铺植平整。LMA凝胶浓度直接关系

8、到DNA迁移长度,0.6%较适宜。第3层LMA可不铺。微量加样器吸头前端残留凝胶勿吹出,以防形成气泡。移去盖玻片时注意勿损伤胶膜)4.裂解4℃凝固后去掉盖玻片,将载玻片浸人新配制的4℃预冷细胞裂解液(含2.5MNaCl,100mMNa2EDTA,10mMTris-HCl(PH=10),用前加1%TritonX-100,10%二甲亚砜(DMSO)),裂解不少于

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