内蒙古绒山羊皮肤毛囊周期生长发育相关mirna鉴定

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1、内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料，与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担一切相关责任。t上二论文作者签名：懿茧三日期：丕!垒笸：!!内蒙古农业大学研究生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识产权的规定，即：

2、研究生在攻读学位期间论文工作的知识产权单位属内蒙古农业大学。本人保证毕业离校后，发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学，且导师为通讯作者，通讯作者单位亦署名为内蒙古农业大学。学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子文档，允许论文被查阈和借阅。学校可以公布学位论文的全部或部分内容(保密内容除外)，采用影印、缩印或其他手段保存论文。论文作者签名：盏盘指导教师签名：么隧日摘要micmRNA(miRNA)是一类20～24nt长度的非蛋白质编码的内源小分子。近年来的研究发现，miRNA作为转录后基因表达调控的一个

3、重要因子，参与表皮和毛囊的发生及周期性发育。本研究采集山羊皮肤毛囊生长期、退行期和休止期的皮肤样本，利用基于Illumina／Solexa原理的小分子RNA深度测序技术，结合生物信息学的方法，对miRNA的类型、丰度、家族及靶基因进行了分析。研究结果丰富了山羊miRNA的数量和种类，更加深刻的了解了miRNA在毛囊周期发育的表达变化。主要研究结果如下：(1)通过Solexa高通量测序技术，分别得到干净数据10644467、11951819和11032157个。对生长期小RNA分类注释获得了3381条保守的miRNA，通过归类统计后，

4、得到miRNA316个。其中68个miRNA在山羊上保守已经在NCBI上报道；余下的248个miRNA在其他物种上保守但在山羊上未见报道。(3)通过家族分析，发现在山羊和绵羊上共表达的miRNh都被定位在了牛21号染色体的同一区段。(4)在绒周期的三个发育时期内共计得到334个保守的miRNA，其中有279个miRNA在三个时期都有表达，并找到生长期特异的miRNAl5个、休止期特异的miRNA7个和退行期特异的miRNA8个。(5)此外，还鉴定得到22个新的miRNA。对新miRNA进行靶基因预测，．得到预测的靶基因86519个，

5、对靶基因进行KEGG分析发现MAPK通路对于皮肤发育有重要作用。无论是已知的和新的miRNA都通过二次测序加以证实。关键词：内蒙古绒山羊；毛囊；Solexa测序：miRNA；鉴定IdentificationofCycle—associatedmiRNAsinInnerMongoliaCashmereGoatSkinandHairFolliclesAbstractMicmRNA(miRNAs)isanewlyidentifiedclassof20～24ntnon-protein-codingandendogenoussmallRNA．

6、RecentresearchesdemonstratedthatalargenumberofmiRNAsareinvolvedinthedevelopmentofepidermisandhairfollicles，andthecyclicaldevelopmentofhairfollicles．Inthissnldy，areasofskinwherethecashmeregrowsinanagen,catagenandtelogenweresampled．Combinedwithbioinformaticmethod，thetype

7、s，abundance，familyandtargetsofmiRNAsingoatwereanalyzedbysmallRNAdeepsequencingteclmology,whichWasbasedonIllumina／Solexaprincipium．TheresultesenrichedtherepertoireofgoatmiRNAsandprovidedmoreprofoundinsightsintomiRNAexpressionchangesinthehairfolliclecycledevelopment。Them

8、ainresultswereasfollows：(1)Weobtained10，644，467reads，11，951，819readsand11,032，157reads，Inanagen，catagenandtelogen，res