绒山羊皮肤毛囊发育不同时期初级、次级毛囊比较转录组学研究

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1、■.,‘.■、分类号S813.3学校代码10129UDC636学号2011201008A#古農嗦硕±学位论文绒山羊皮肤毛囊发育不同时期初级、次级毛囊比较转录组学研究TheComparativeTranscriptomeStudyonCashmereGoatsfromDiferentStageofPrimaryandSecondaryHairFolliclesDeve!opment申请人:江巧学科口类:农学学科专业;动物遗传育种与繁殖研究方向;绒

2、山羊分子遠传育种指导教师:李金泉教授苏蕊副教授论文提交日期-:二〇五年六月内蒙古农业大学研究生学位论文独创声明本人申明所呈交的学位论文是我本人在导师指导下进行的研巧。据我所知工作及取得的研巧成果,除了文中特别加标注和致谢的地方外,论文中不包括其他人己经发表或撰写过的研究成果,也不包括为获得我校或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一,与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢怠。一申请学位论文与资料若有不实之处,本人承担切相关责任。论文作者签名:I日期:占八、内蒙古

3、农业大学研宛生学位论文版权使用授权书本人完全了解内蒙古农业大学有关保护知识卢权的规定,即:研巧生在攻读学位期间论文工作的知识产极单位属財蒙古农业大学。本人保证毕业离校后,发表论文或使用论文工作成果时署名单位为内蒙古农业大学,且导师为通讯作者,通讯作者单位亦署名为内巧古农业大学。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子文档,允许论文被査阅和借阅。学校可公布学位论文的全部或部分内容(保密内容除外)、缩印或其他手段保存论文。,采用影印论文作者签名:指导教师签名¥鄉瓜日期、,。:如&摘要内蒙古

4、绒山羊具有优良的产绒性状,是宝贵的种质遗传资源,因此研究绒山羊的绒毛发育机理,探寻与绒毛生长相关的重要候选基因就显得尤为重要。本试验采用高通量测序技术,选取3只内蒙古白绒山羊绒毛发育不同时期(生长期11月份、退行期1月份、休止期3月份)体侧部皮肤初级毛裹和次级毛囊各3个RNA样本,等量混合后进行转录组测序-,并对结果进行生物信息学分析及qRTPCR验证。试验结果显示:1、试验分别对3只不同生长时期绒山羊的初级、次级毛裹进行了组间和组内的差异基因筛选,共得到9组差异基因,并对差异基因进行了GO和Pathway分析。GO分

5、析显示:显著富集的条目大多与组织细胞外基质、核糖体结构组成、细胞平移伸长、胞质小核糖体、肌动蛋白及维生素K的代谢过程有关。Pathway分析显示:差异基因主要在核糖体代谢、氨基酸代谢、维生素代谢、硫代谢、新霉素生物合成等功能上影响显著。2、试验对绒山羊不同生长时期初级、次级毛囊组内进行差异基因筛选,发现这些基因都有8种连续的趋势变化,分别是;downdowndown!upup如wn;downupdown;downupup;updowndown;udownu;downdownu;uu;且在初、

6、ppppupp次级毛衰组内前H种趋势都较为显著。对这8中趋势的差异基因进行分析研究,将对挖掘绒山羊毛囊(尤其是次级毛囊)周期性生长调控机理提供有力依据。3RT-PCR、试验采用q技术对绒山羊毛囊发育的11月份及3月份的LGR5和SOSTDC1基因的转录组测序结果进行验证。结果显示、SOSTDC1,待测基因LGR5一在绒山羊毛囊发育的11月份相对表达量显著高于3月份。这与测序结果基本致。说明测序结果真实有效。-关键词:内蒙古绒山羊;毛囊RNAse巧光定量PCR;q;TheComarativeTranscripl:o

7、meStudonCashmereGoatsfrompyDifferentShgeofrimarandsecondarHairFolliclesdevelomentpyypAbstractInnerMongoliaCashmereoatsMCGsarevaluableermlasme打eticresourcesg(^)gpgbecauseofhavi打gmanyexcellentcashmereproductiontraits.Soitisparticularlyort

8、,impanttosUidyIMCGshairgrowthmechanismand

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