蒙古马运动候选基因ppargc1a多态性和表达量研究

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1、分类号S813.3学校代码10129UDC636学号2009201012蒙古马运动候选基因PPARGC1A多态性和表达量研究TheInvestigationofPolymorphismandExpression’sQuantityonAthleticsCandidateGenePPARGC1AinMongolianHorses申请人：乌日古木拉学科门类：农学学科专业：动物遗传育种与繁殖研究方向：分子数量遗传学与马的遗传育种指导教师：芒来教授论文提交日期：二〇一二年五月摘要过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1A(peroxisomeproliferators-

2、activatedreceptor-γcoactivator1A,PPARGC1A)是核受体PPARγ的一种转录辅激活因子，又称PGC-1α。PPARGC1A在线粒体生物合成，骨骼肌适应过程，糖代谢及脂肪酸氧化过程中起着十分重要的作用。但马的PPARGC1A基因SNPs及表达量的研究目前在我国还较少。本研究是由两个内容组成的。实验一的内容：根据GenBank中已公布的PPARGC1A基因序列设计引物，从乌珠穆沁马、乌审马、乌拉特马、巴尔虎马血液基因组DNA中扩增13个外显子基因片段，利用PCR-SSCP技术分析，测序后，对其序列结构、核苷酸组成及所编码的氨基酸进

3、行了初步研究。研究结果表明：在检测的13个外显子中只有第五外显子外显子存在多态，该多态位点由A和B两种等位基因控制。PPARGC1A基因第58295bp处一个A→G的突变导致等位基因A变为等位基因B。在PPARGC1A基因第五外显子上，不同品种马都是等位基因A较等位基因B占优势，AA型是优势基因型。在此多态位点，只有乌审马处于Hardy–Weinberg平衡状态，其余乌珠穆沁马、乌拉特马、巴尔虎马都未达到平衡状态。实验二的内容：通过荧光定量PCR的方法，分别以2岁蒙古马和4岁蒙古马PPARGC1A基因为模板，检测了该基因mRNA表达量，并分析了表达差异。结果发现

4、，4岁蒙古马PPARGC1A基因mRNA表达量为2岁蒙古马的1.35倍，但经过统计分析检验，得出2岁马和4岁马臀中肌PPARGC1A基因表达差异不显著。以上结果初步揭示了，蒙古马PPARGC1A基因外显子序列高度保守；而对于其基因表达的变化的初步研究为今后进一步进行蒙古马耐力的相关研究奠定基础。关键词：蒙古马；PPARGC1A基因；PCR-SSCP；荧光定量PCR；表达量TheInvestigationofPolymorphismandExpression’squantityonAthleticsCandidateGenePPARGC1AinMongolianH

5、orsesAbstractPeroxisomeproliferators-activatedreceptor-γcoactivator1A,PPARGC1AisatranscriptioncoactivatorofnuclearreceptorPPARγ,alsoknownasPGC-1α.PPARGC1Aplayanimportantroleinmitochondrionbiosynthesis,skeletalmuscleadaptation,glycometabolismandfattyacidoxidation.However,thereislessst

6、udyofSNPsandexpressionofPPARGC1Aofhorseinourcountry.Thestudyincludedtwocontents.First，accordingtothesequenceontheGenbankofPeroxisomeproliferators-activatedreceptor-γcoactivator1Atodesignedprimers,amplifi-edthe13exonsofPPARGC1AfromgenomeDNAoffourspeciesMongolianhorse(Wuzhumqin,Wushen,

7、WulateandBaraghorse),andanalyzedbyPCR-SSCPin100Mo-ngolianhorse,andsequencingtheexonwhichhavepolymorphism,andinitialstudyeditssequencestructure,nucleotidecompositionandcodingaminoacid.Theresultsshowedththattherewereonly5exonexistpolymorphismsfor13exonsofPPARGC1A,thispolymorphicsitecon

8、trolledbytwo