myod1基因与猪肉质性状相关性分析

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1、河北农业大学硕士学位论文MyoD1基因与猪肉质性状相关性分析姓名：赵广珍申请学位级别：硕士专业：动物遗传育种与繁殖指导教师：贾青20120520摘要IIIIIHIIIIMillIIIIII

2、＼2143232肌分化基因(MyoDl)对猪的生长和肌肉的产生起着关键的作用，可使许多类型的细胞(如成纤维细胞、脂肪细胞等)转化为成肌细胞并分化为成熟的肌纤维。目前在国内还未见关于猪的MyoDl基因外显子1的突变位点的报道，国外鲜有报道。分析MyoDl基因结构，研究该基因的变异，探讨变异位点与猪肉质性状的关系，可为猪的肉质改良提供分子基础。随机选

3、择140头杜×长×大三元商品杂交猪屠宰。常规方法测定滴水损失、pH、肉色、大理石花纹、剪切力、肌内脂肪含量；运用Bioe(1it、BLAST、SMART、ProtParam、SOPMA等软件和在线工具，对猪MyoDl基因进行生物信息学分析。采用PCR-SSCP技术分析MyoDl基因第1外显子的单核苷酸多态性，一般线性模型分析基因型与猪肉质性状的关联性。显微镜观察肌肉石蜡切片并测定肌纤维的密度、直径、面积、长径、短径和长短径比，分析肌肉组织学特性与肉质性状的关系。所构建不同物种的聚类图显示猪与牛羊的MyoDl基因结构最为相似：MyoD

4、l基因存在较强的密码子偏爱性；MyoDl蛋白由BASIC(碱性)结构、HLH结构域和Pfam：Myf5结构域和由2个低复杂度区域(LCR)组成；该二级结构主要由无规则卷曲和u螺旋构成，在该蛋白上没有发现合适的信号肽；磷酸化位点主要发生在Set、Thr和Tyr上。在MyoDl基因5'UTR的119bp处发现G>A的突变，在其第l外显子387bp处发现C>T突变，经检测这2个突变均为AA和AB基因型，2个变异位点在群体中都是从型为优势基因型，各位点基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡。在5'UTR上的突变对猪肌肉的肌内脂肪含量

5、和pH呈显著影响(p0．05)。对肌纤维特性进行相关分析结果显示，密度与剪切力和大理石花纹呈负相关(pA突变对猪肌肉的肌内脂肪和pH有显著影响，在MyoDl基因外显子1上的C>T突变为同义突变对肉质性状无显著影响；肌纤维特性对大理石花纹有显著影响；MyoDl基因的AA纯合基因型可使肌纤维的直径、长径、短径和面积增大，使密度降低。关键词：猪：MyoDl基

6、因；肉质性状；PCR-SSCP；肌纤维RelationshipAnalysisbetweenMyoDlGeneandMeatQualityTraitsinPigPostgraduate：ZhaoGuangzhenMajor：AnimalGeneticsBreedingandReproductionDirection：AnimalGeneticsTutor：JiaQingAbstractPorcinemyogenicdifferentiationgenes(MyoDl)playakeyroleingrowthandmuscledeve

7、lopment．Lotsofothertypesofcell(suchasfibroblasts，adiposecells)weretransformedtomyoblastswhichweredifferentiatedintomaturemusclefibers．NoreportonthemutationalsitesinMyoDlgeneexonlhasbeenfoundinpigindomestic,andlessreportinabroad．TheAnalyzingthestructureofMyoD1gene，explo

8、ringitsvariationandresearchingontheinfluenceofthevariationlociwithporkqualitytraitswillprovideafuthermolecularbasisforporcinemeatqualityimproved．140Duroc×LandracexYorkhybridpigswererandomselectedandslaughtered．Meatqualitytraitsincludedriploss，pHvaluefleshcolorshearforc

9、eandIMFweremeasuredbyconventionalmethod．Bioinformaticalanalysiswasexecutedwiththeaidofthesol[wareandonlinetools，inclu