猪opn基因与繁殖性状的关联分析

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1、农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(3):412~416窑研究论文窑猪基因与繁殖性状的关联分析*1,2,王立贤1**,孙世铎2罗仍卓么(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100094;2.西北农林科技大学动物科技学院,杨凌712100)摘要:骨桥蛋白(osteopontin,)基因是近年来在猪繁殖性状上发现的一个候选基因。实验以长白猪,大白猪和北京黑猪为研究对象,研究基因多态性与猪繁殖性状之间的关联。经特异性产物的扩增并结合测序发现,基因的第

2、6内含子存在305bp的缺失突变而产生多态。在长白猪和大白猪中发现了AA、AB和BB3种基因型,均处于中度多态,且已达到HardyWeinberg平衡状态;在北京黑猪群体中没有多态,只有基因型。利用SAS8.2软件采用最小二乘法拟合线性模型,将不同基因型与总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和初生重(WB)进行了关联分析,结果表明,长白猪初产母猪AA型个体的TNB和NBA显著高于AB和BB型个体(<0.05),经产母猪AB型个体的TNB和NBA显著高于AA型与BB型个体(<0.05),A等位基因对TNB、NBA

3、和WB均表现为正效应。在大白猪中,不论是初产母猪还是经产母猪,BB和AB型个体的TNB和NBA高于AA型个体,但差异不显著(>0.05),B等位基因对TNB和NBA都表现为正效应。关键词:猪;(osteopontin)基因;多态性;繁殖性状;关联分析中图分类号:S188文献标识码:A 文章编号:10061304(2008)03041205GeneticPolymorphismofPigGeneandIts CorrelationwithReproductiveTraits LUORENGZhuoma 1,2,WA

4、NGLixian 1**,SUNShiduo 2Osteopontin渊冤genewasregardedasacandidategeneforpigreproductivetraits.Inthisexperiment,therelationshipbetweengeneticpolymorphismofgeneandreproductivetraitswasstudiedinLandracepig,LargeWhitepigandBeijingBlackpig.Thepolymorphismwasfoundby

5、thePCR,whichwasinducedbythedeletionmutationof305bpinthesixthintronofgeneaftersequencing.AA,ABandBBgenotypeswerefoundinLandracepigandLargeWhitepigpopulations,whichshowedamoderatepolymorphism,andstatisticalresultsof字2testindicatedthatthislocusfittedHardyWeinber

6、gequilibrium;WhilethispolymorphismwasnotfoundinBeijingBlackpig,andonlyBBgenotypepresentinit.Meanwhile,effectofpolymorphismforgeneontotalnumberborn(TNB),numberbornalive(NBA)andbornweight(WB)wereanalyzed.ResultsindicatedthatthefirstparityLandracepigwithAAgenoty

7、peshowedmoreTNBandNBAthanthatwithABandBBgenotypesignificantly(<0.05),theindividualofmultiparoussowswithABgenotypeshowedmoreTNBandNBAthanthatwithAAandBBgenotypesignificantly(< 0.05),andAallelehadthepositiveeffectiveonTNB,NBAandWB.WhileinLargeWhitepig,theTNBand

8、NBAofsowwithBBandABgenotypeweremorethanthosewithgenotypeAA,buttheresultsshowednosignificantdifference(>0.05),andBallelehadthepositiveeffectiveonTNBandNBA. pig; (osteopontin);polymorphism;

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