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《大豆转录因子gmmyb52的克隆、表达及结合功能分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2017,43(10):14581467http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2017.01458大豆转录因子GmMYB52的克隆、表达及结合功能分析******许玲王元琮何晓兰黄益洪徐照龙邵宏波张大勇江苏省农业科学院农业资源与环境研究所/盐土农业研究中心,江苏南京210014摘要:MY
2、B类转录因子在植物的生长发育和逆境响应中有重要的调控作用。依据课题组前期获得的盐胁迫相关的数字表达谱(DGEP)数据,获得盐胁迫响应显著上调基因GmMYB52,利用RT-PCR方法从栽培大豆(Williams82)中克隆该基因片段,并与已公布的Williams82基因组数据库序列比对,该基因与GmMYB52序列一致。生物信息学分析表明,GmMYB52编码区(CDS)全长1083bp,编码360个氨基酸。其编码的氨基酸序列具有MYB类转录因子的共同特征,其距N端110~160氨基酸残基处有MYB结构域;系统
3、进化树分析表明,该基因编码的蛋白与GmMYB62、拟南芥AtMYBSt1、苜蓿MtMYB52、水稻OsMYBS3及木豆CcMYB-likeproteinJ的亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果表明,大豆根部GmMYB52的转录水平受外界非生物逆境的调控,用脱落酸(ABA)和低温(4℃)处理后12h明显上调,用氯化钠和PEG处理0.5~24.0h后检测到GmMYB52的转录水平在50%~600%区间内呈现出先上调后下调再上调的趋势。GmMYB52为组成型表达,在大豆的幼苗期和开花期表达较多,在成熟期表达相对
4、较低。GmMYB52在茎叶与开花期的花中表达较强,在根的表达较弱,而在成熟期的豆荚中几乎不表达。亚细胞定位的结果表明,GmMYB52定位于细胞核,符合典型转录因子的定位特征。酵母杂交系统检测表明,GmMYB52具有转录激活特征,并且能够与MYB相关顺式作用元件基序相结合。本研究结果表明,GmMYB52编码典型的MYB转录因子,具有转录激活活性及DNA结合活性,在大豆中的表达可能与大豆的非生物胁迫和ABA信号转导途径有关,推测其可能参与了大豆对非生物胁迫的响应。关键词:大豆;GmMYB52;表达分析;转录激
5、活功能;结合功能Isolation,ExpressionandBindingFunctionAnalysisoftheTranscriptionFac-torGmMYB52inSoybean*****XULing,WANGYuan-Cong,HEXiao-Lan,HUANGYi-Hong,XUZhao-Long,SHAOHong-Bo,and*ZHANGDa-YongInstituteofAgriculturalResourcesandEnvironment,JiangsuAcademyofAgricul
6、turalSciences/Salt-soilAgriculturalResearchCenter,Nanjing210014,ChinaAbstract:TheMYBtypetranscriptionfactorsareinvolvedinplantdevelopmentandresponsetoabioticstress.GmMYB52wassignificantlyup-regulatedaftersalttreatment.InordertogainmoreinformationaboutGmMY
7、B52,GmMYB52ofWilliams82wasclonedbyRT-PCR.BioinformaticanalysisshowedtheCDSofGmMYB52was1083bp,encoding360aminoacidresidues.AMYBdomainwasfoundintheregionof110to160aminoacidresiduesfromN-terminal.BlastresultsshowedthatGmMYB52arehighlyhomologoustoGmMYB62,AtMY
8、BSt1fromArabidopsis,MtMYB52fromMedicagosativa,OsMYBS3fromOryzasativa,andCcMYB-likeproteinJfromCajanuscajan.QuantitativePCR(qPCR)resultsindicatedthatthetranscriptionlevelofGmMYB52wasupregulatedunderABAandlowtemperatu