disovery studio 药物发现与生物大分子计算模拟平台

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1、.DiscoveryStudio 药物发现与生物大分子计算模拟平台 个人电脑上的全新分子建模环境，专业的生命科学分子模拟软件[PDF资料下载]  DiscoveryStudio™(简称DS),基于Windows/Linux系统和个人电脑、面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、优化和药物设计工具。通过高质量的图形、多年验证的技术以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息

2、共享提供平台。   建立在最新的流程管理平台PipelinePilot基础上的DS让数据的共享和交流变得更为方便和简洁。DS中的部分功能流程(protocols)可以在PipelinePilot中进行编辑和组合，编辑组合而得的新流程可以导入DiscoveryStudio中使用，这样使得科研流程的方便共享成为可能。同时，PipelinePilot这个开放平台技术还为使用者整合自己的或第三方的软件工具提供了接口。科研人员可以在一个统一的平台上完成从基因到先导化合物设计的一系列工作，并且可以通过web形式共享研究成果。  DS的服务器-客户端模式使得科研人员能够最方便且最大限度地实现计算资源共

3、享。  DS目前的主要功能包括：蛋白质的表征（包括蛋白-蛋白相互作用）、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具（包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接）、基于小分子的药物设计工具（包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET）和组合库的设计与分析等。DS可以应用于生命科学以下研究领域：新药发现，生物信息学，结构生物学，酶学，免疫学，病毒学，遗传与发育生物学，肿瘤研究。一、DiscoveryStudio功能模块简介  二、DiscoveryStudio可以运行的硬件平台...三、Accelrys软件应用于生命科学Accelrys软件应用于生命科学Disc

4、overyStudio功能模块简介-基本界面和显示模块  DiscoveryStudioStandalone  DiscoveryStudioVisualizerClient-蛋白质模拟模块  DSMODELER  DSProteinRefine  DSProteinHealth  DSProteinFamilies  DSSequenceAnalysis-基于结构的药物发现和设计模块  DSFlexibleDocking   DSLigandFit  DSLigandScore  DSLibDock  DSCDOCKER  DSProteinDocking   DSLudi  DSDe

5、NovoEvolution   DSLigandFitCAP/DSLudiCAP  DSGOLDinterface-基于药效团的药物发现和设计模块  DSCatalystConformation  DSCatalystHypothesis  DSCatalystSBP  DSCatalystScore  DSCatalystShape...  DSCatalystDBBuild  DSCatalystDBSearch  DSDeNovoLigandBuilder  HypoDB  PCDB(PharmaCoreDB)-基于小分子的药物发现和设计模块   DSQSAR  GFACompon

6、ent  VAMPDescriptorsComponent/DMol3DescriptorsComponent   DSLibraryDesign  DSADMET  DSTOPKAT-分子力学和分子动力学计算模块  DSCHARMm  DSCHARMmLite   DSCFF(高级II类力场)   DSMMFF(MerckMolecularForceField)-分析模块  DSBiopolymer  DSAnalysis基本界面和显示模块·DiscoveryStudioStandalone可视化界面，是利用DiscoveryStudio软件进行分子设计和模拟的基础，支持服务器-客户端

7、安装在同一台机器上的运行模式。与PipelinePilotServer结合在一起，提供化学/生物学数据显示、模拟/分析、构建三维分子、展示动态变化、三维作图及许多其它功能。 ·DiscoveryStudioVisualizerClient是服务器-客户端运行模式中、客户端的可视化界面，用于访问和使用服务器端的DiscoveryStudio...软件。必须与服务器端配置的PipelinePilotServer协同工作，为用户提供无与伦