天然三倍楷杷基因表达倍性效应的cdna-aflp研究

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1、西南大学硕士学位论文天然三倍楷杷基因表达倍性效应的cDNA--AFLP研究姓名:孙晓荣申请学位级别:硕士专业:果树学指导教师:梁国鲁20120603摘要天然三倍体枇杷基因表达倍性效应的cDNA—AFLP研究果树学专业硕士研究生:孙晓荣指导老师:梁国鲁研究员.三倍体枇杷在生长势、枝条粗度、叶片大小和厚度、叶片组织结构、花器官及果实特性等方面表现出较明显的优势,其无核性状显著提高了果实的可食率,其基因表达和调控机制尚无研究。本试验以同源三倍体枇杷品种单株“森尾早生”和“常白一号”的嫩叶、花蕾和幼果为材料,并以其相应的二倍体嫩叶、花蕾和幼果为对照采用LiCl.C

2、TAJ3的方法提取总ImA,合成cDNA双链,以此为模板进行AFLP分析,对差异片段进行回收、克隆,经测序后进行同源性比对分析。研究结果如下:(1)从20对引物组合中选出了14对引物组合进行扩增,共得到3695条带,其中筛选获得148条差异表达转录衍生片段(TDF),约占总扩增条带的4%。(2)同源三倍体枇杷只有约1%左右的位点发生了变化,且在不同器官中位点的表达变化存在差异。即嫩叶沉默位点多于激活位点,花蕾激活位点多于沉默位点,而在幼果中表现不规律性。(3)同一位点在不同三倍体单株中的多态性表达存在差异,获得的148个TDF在三倍体枇杷各器官的表达以基因

3、沉默为主。(4)148个差异基因片段的序列在NCBI中进行B1aS仅功能分析,涉及转录调控、代谢过程、抗病性、信号传导、蛋白质合成与降解、细胞组分、未命名蛋白或预测蛋白等功能,还包括一些未找到同源序列和同源性较低的序列。(5)同源三倍体枇杷中表现出基因激活且同源性较高的差异片段分别为TDFl、TDF27、11)F42、TDF46、TDF47、TDF53、TDF93、TDFl09、TDFll7,未找到同源序列或同源性较低的序列为Ⅱ)F60、TDF82、,mF91、TDF95、TDFl01、TDFl02、TDFl07、TDFll6、TDFl36、TDFl42,

4、编号依次为A1.A10(A.a嘶vadon)。(6)同源三倍体枇杷中表现出基因沉默的差异片段分别为TDFlO、TDF5l、TDF70、TDF85、TDFl03、硼DFl10、TDFll2、TDFl20、,mFl21、TDFl22、TDFl24、Ⅱ)F144,全为未知基因,编号依次为S1一S12(S.sil朗ce)。(7)TDF74在两个同源三倍体枇杷品种及其二倍体中共表达,且与蓖麻的锌指H西南大学硕士学位论文蛋白同源性较高。关键词:同源三倍体枇杷,倍性效应,基因表达,CDNA.AFLPAbs仃actStlldyOnQnesDifferentiaUyExpr

5、essedbetween1tiploidandDiploidLoquatm易D咖歹印口以良礁Lindl.)UsingCDNA-AFLPanalysisCandidate:SunXiaorongSupeⅣisors:ProfessorLiangGu01uAbs打actThetriploid10q啦吐showedmoresiglli丘c锄tgrowtlladV印妇gesinmegrowtllpotentialofmebranc:hes,di锄曲%leafsize,thickness,leaftissuestm咖re,floral讲翟阻lsand觚tch聪眦嘶s

6、tic.Andnucle小丘ee,greatlyimproVcdt11e丘uitedible.HoweV%itsgenec)【press锄dre则ationmechalli锄缸er10tcleaLh1this唧耐m毗meyoung1eaVes,buds柚dyoullg觚itsofhomologollstriploidv耐etics“s锄Ⅳcizaoshell岔’and”chall曲aiyilla0”werc觞mat萌als,aIldtlleirsdiploidyoungleaVes,budsandyoung蜘tSwere淞con乜-0ls.1kme吐10d

7、ofLiCl·CTABw弱IlScdtocXn铽total鼬、『A,andcDNAw嬲syIldlesizcdt0璐cdas廿let锄1platc如rc£INA-AFLPaIlalysis.Di绦鹏矾alf.ra舯锄tswererec0Vered,cloned锄dsequ∞ced,andmeresunsareasfIollows:(1)3695trans嘶ptd舐Ved劬舯e幽weregotbyusiIlgfIo谢eeIlpairSof删嘶粥脚airscombmatio娜,锄dof148仃ans嘶ptdedVed劬gm∞tswerc90t,aocolHl血

8、gfor4%of恤etotalanlplifiedb锄ds.(2)

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