微流芯片鉴定并分析马拉色菌属菌种基因型的初步研究

《微流芯片鉴定并分析马拉色菌属菌种基因型的初步研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、微流芯片鉴定并分析马拉色菌属菌种基因型的初步研究StudyontheidentificationandanalyzationofMalasseziaspeciesusingMicro-FluidicChips硕士研究生：王韵茹硕士生导师：章强强教授导师组成员：朱敏副主任医师李莉主管技师朱均昊技师目录中文摘要1英文摘要3目U55第一部分：马拉色菌属的分类及其在常见皮肤病的分布情况弓丨7材料与方法7織n14第二部分：利用微流芯片鉴定并研究马拉色菌属菌种基因型弓丨*16材料与方法16觀18舰22全文小结25参考文献26纖29隱3839复旦

2、大学硕士学位论文中文摘要第一部分：马拉色菌属的分类及其在常见皮肤病的分布情况目的：研究马拉色菌属的分类及其在二种常见马拉色菌相关疾病中的分布情况。方法：以标准株作对照，釆用PCR扩增rDNAITS2区并测序的分子生物学方法，将来源于花斑糠疹和马拉色菌毛囊炎的马拉色菌进行分类鉴定，分析各菌种在这二种疾病的分布情况。结果：从72例花斑糠疹和11例马拉色菌毛囊炎患者皮损处分离到7个菌种，共83株马拉色菌。鉴定出合轴马拉色菌41株（49.40%)、糠秕马拉色菌26株(31.33%)、球形马拉色菌10株(12.05%)、日本马拉色菌2株（2.

3、41%)、限制马拉色菌1株（1.20%)、大和马拉色菌1株（1.20%)、皮炎马拉色菌1株（1.20%)及合轴与糠秕的混合感染1株（1.20%)。二种疾病菌种构成与疾病类型无明显关系，近半数花斑糠疹患者皮损中分离出合轴马拉色菌，而马拉色菌毛囊炎患者皮损中分离出的菌种无显著差异。结论:不同疾病马拉色菌菌种构成可能不同，合轴马拉色菌与花斑糠疹密切相关；马拉色菌rDNA的ITS2区PCR扩增与测序可用于马拉色菌的分类鉴定。第二部分：利用微流芯片鉴定并分析马拉色菌属菌种基因型目的：探讨微流芯片在马拉色菌鉴定与分型中的应用优势。方法：采用DN

4、A测序的方法，将临床收集的菌株鉴定至种；选取临床最常见的糠秕、合轴和球形马拉色菌等7种马拉色菌分别进行RATO-PCR扩增，将PCR产物进行微流芯片的菌种基因型鉴定。结果：大多数菌株均可被2种随机引物(S22、S24)扩增而获得清晰条带，但以S22引物扩增的条带更为稳定、清晰，作为本研究主要引物。不同种马拉色菌通过微流芯片基因型定量分析得到不同大小的固定阳性条带，所有菌株均可见种间和种复旦大学硕士学位论文内多态性。使用RAPD结合微流芯片方法，基本可将8种马拉色菌（糠秕、合轴、球形、厚皮、斯洛菲、日本、大和及皮肤马拉色菌）区分开来。

5、结论：RAPD结合微流芯片方法作为一种快速、高通量、高灵敏性的分析技术，在马拉色菌种间菌株遗传多样性、亲缘关系的分析及新种鉴定中显示出一定优越性，适合用于流行病学分析。关键词：马拉色菌属；微流芯片；基因型；花斑糠疹；马拉色菌毛囊炎中图分类号：R75皮肤病学与性科学复旦大学硕士学位论文AbstractPartI：ClassificationofGenusMalasseziaandtheirdistributionincommonMalassezia-relatedDiseasesObjective:Tostudytheclassifi

6、cationofGenusMalasseziaandtheirdistributionintwocommonMa/a^ez/a-relatedskindiseases.Methods:ToanalyzetheassociationbetweenMalasseziaspeciesandpityriasisversicoloraswellasMalasseziafolliculitisbyisolatingpathogenfrompatientswiththediseases，andstandardstrainswereascontro

7、l.TheclinicalisolateswereidentifiedwithDNAsequencing,usingITS2regionPCR.Results:Atotalof83Malasseziaisolateswereobtainedfrom72patientswithpityriasisversicolorand11patientswithMalasseziafolliculitis,including41strainsofMalasseziasympodialis(49.40%),26strainsofMalassezia

8、furfur(31.33%)，10strainsofMalasseziaglobosa(12.05%)，2strainsofMalasseziajaponica(2.41%)，1strainofMalasseziarestricta(