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时间:2019-02-15
《筱翅无声蝗(asonus+brachypterus)线粒体基因组测定和的分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、ClassifiedIndex:CODE:10075U.D.C.:NO:20101228ADissertationfortheDegreeofM.ScienceSequencedeterminationandanalysisofmtDNAforAsonusbrachypterusCandidate:DingBoyangSupervisor:ProfessorZhangDaochuanAssociateProfessorLiXinjiangAcademicDegreeAppliedfor:MasterofScienceSpecialty:ZoologyUn
2、iversity:HebeiUniversityDateofOralExamination:June,2013摘要摘要本研究利用PCR直接测序与克隆测序相结合的方法测定了筱翅无声蝗(Asonusbrachypterus)的线粒体基因组序列,并与GenBank上获得的4种网翅蝗线粒体基因组进行了比较分析,以癞蝗科宽纹蠢蝗为外群,采用BI法、ML法和NJ法构建系统树,对网翅蝗科的系统发育关系进行了初步探讨。主要结论如下:1、筱翅无声蝗线粒体已测得长度为14640bp,分为37个基因编码片段,即13个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因,2个核糖体RNA基因。
3、各个基因的排列顺序与典型的节肢动物线粒体基因组的基因排列顺序相比,存在一处重排,即trnD和trnK位置发生颠倒。2、筱翅无声蝗的线粒体基因组已知序列存在显著的A-T碱基偏向性,A+T含量为74.9%。不同的功能区域的A+T含量略有差异,13个蛋白质编码区基因A+T含量为74.74%,22个转运RNA基因的A+T含量为73.34%。3、筱翅无声蝗的蛋白质编码基因全部使用标准的ATN为起始密码子;终止密码子主要是TAA,其次是TAG(nad5),另有5个蛋白质编码基因使用了不完整的终止密码子T(nad4、nad2、cox1、cox2和nad6)。4、5种网
4、翅蝗线粒体基因组比较分析显示,黄脊竹蝗与其余4种差异明显:仅黄脊竹蝗的cox1基因起始密码子为CCG,其余四种网翅蝗科蝗虫cox1基因起始密码子均为ATN;黄脊竹蝗的线粒体基因组在重叠和间隔区域的长度和位置上与其余4种网翅蝗科蝗虫明显不同。另外,筱翅无声蝗的线粒体基因组在重叠和间隔区域的长度和位置上也具有自身的特点。5、BI法、ML法和NJ法重建的网翅蝗科3亚科5种蝗虫的系统树拓扑结构较一致,网翅蝗科中竹蝗亚科最先分出,网翅蝗亚科的单系性没有得到较好支持,无声蝗亚科与网翅蝗亚科聚在一支,网翅蝗亚科不是单系群。关键词:筱翅无声蝗网翅蝗科线粒体基因组系统发育
5、关系IAbstractAbstractInthisstudy,thesequenceofAsonusbrachypterusofAsoninaegenomewasdeterminedbyusingPCRandclone.Thestructure,nucleotidesconposition,genesarrangement,andsynonymouscodonsusagebiasetc.oftheAsonusbrachypterusgenomewasanalyzed.Reconstructthephylogenetictreebasedon5subspe
6、ciesofArcypteridae,Thrinchusschrenkiiistheoutgroup,byML,BIandNJmethods.Theconclusionthatofthisarticlewereshowasfollows:1.TheknownmitochondrialgenomeofAsonusbrachypterusis14640bp.Allgenomecontentsconsistof13protein-codinggenes,2rRNAgenes,22tRNAgenes.ThetrnDandtrnKgeneshavechangedi
7、tspositionswhichrelativetotheputativeancestralarthropodmtDNAgenearrangement.2.ThebasedisparityintheAsonusbrachypterusmitochondrialgenomesareseriously,thecontentofATofindifferentfunctionalgenesisdiversity.ThecontentofATis74.9%.Intheprotein-codinggenes,theATscopeis74.74%.TheATconte
8、ntoftRNAis73.34%.3.Allcodonsofprotein-co
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