木通红碦木虱线粒体基因组测定与分析

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1、分类号：；密级ＵＤＣ：学号：Ｓ２００８０６３南昌大学硕±研究生学位论文木通红掩木風线粒体基因组测定与分析ＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎｄＡｎａｌｙｚｉｎｇＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＧｅｎｏｍｅｏｆＣａｃｏｐｓｙｌｌａｃｏｃｃｉｎｅａ金巧培养单位（院、系）；生命科学学院指导教师姓名、职称：夏斌教授申请学位的学科口类：理学学科专业名称：微生物学论文答辩日期：２０１５年１２月１３日答辩委员会主席：薛芳森评阅人：魏洪义李玉萍２０１５年１２月２５日学位论文独创性声明￣￣一、学位论

2、文独创獲声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研巧工作及取得的研巧成果。据我所知，除了文中特别加Ｗ标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得南昌大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研巧所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字日期：＞（手写）５年月１６二、学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解南昌大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被

3、查阅和借阅。本人授权南昌大学可１＾｜将学位论文的全部或部分内容编入有关、数据库进行检索，可采用影印缩印或扫描等复制手段保存、汇编本学位论文。同时授权北京万方数据股份有限公司和中国学术期刊（光盘版）电子杂ｉ社将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》和《中国优秀博硕±学位论文全文数据库》中全文发表，并通过网络向社会公众提供信息服务，同意按＂＂章程规定享受相关权益。学位论文作者签名（手写＾导师签名（手写签字日期：年；＞月日签字日期：又０作年１月＾＾＾日／￣＾题目木红嘻木Ｅ线粒体基因组测定与分Ｉ姓名金巧学号Ｓ２００８０

4、６３＾级别博±口硕±＾ＩＩ院／系／所生命科学院微生物＾联系电话Ｅｊｔｎａｉｌ通信地址邮编：（）备注：＂＂Ｓ（，后公开）／公开□保密向校学位办申请获批准为保密年＿＿月ＩＭｓ巧要本文Ｗ木通红啥木風Ｃａｃｏ／７５ｙ航ｔｃｏｃｃ加ｅａ为研究对象，进行了线粒体基因组的测定与特征分析，并构建了系统发育树，旨在了解木通红喀木風在同翅目中系统进化地位。主要研究结果如下；。本研究成功测定了木通红喀木風全线粒体基因组，其全长为１４８３２ｂｐ１），包括一１３个蛋白质编码基因、２２个转运ＲＮＡ基因、２个核糖体Ｒ

5、ＮＡ基因和个ＡＴ富含区２－ｂ）存在１６个基因间隔区５１，全长３５ｂ和基；（其间隔范围１ｐ共２ｐ）－４化之间８３ｂ３）因重叠区１０个運叠范围在１Ｐ，全长共ｐ）；该昆虫线粒体全基因组、ｒＲＮＡ和ＰＣＣＪｓ的ＡＴ含量分别为７２．０４％、７７．０６％和７０．０５％，其中蛋白质编码基因中密码子第３位点的ＡＴ含量高于其它２位位点，Ｌ链密码子第２位７９－－位点的ＡＴ含量最髙．６５％４，值为：）蛋白质编码基因的ＡＴ偏斜和ＧＣ偏斜皆为负值；５）蛋白质编码基因均Ｗ典型的ＡＴＮ为起始密码子：大多数的终止密）码子为完整的ＴＡＧ和ＴＡＡ，也存在不完整

6、的Ｔ该昆虫线粒体基因组中氨；６基酸主要由６种疏水性的苯丙氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丝氨酸和缀氨酸组成７）１１＾乂最长的有７２６，而最短的仅有５４６，１１１８１外其余具；９９除１有典型的Ｈ叶草二级结构二－Ｄ－，同时ｔＲＮＡ级结构中存在缺失Ｔ臂或臂，还存在接受碱基错配ｉＷ木通红喀木風、构杞木風和脉斑银木ＥＨ种島虫为材料，采用比较基因组学和生物信息学为手段，分析木或科线粒体基因组的分子组成特征。结果表明：１）Ｈ种昆虫基因组大小相似，；２）与其它两种昆虫相比木通红咯木武线粒体ｔｍＶ基因发生重排；３）脉斑银木風间隔区最长，而

7、构杞木武重叠区为最大；４）呈种昆虫ＡＴ含量基本相似，均约为７０％；５）Ｈ种昆虫存在碱基不对称，其中Ｈ－链和以链上的第３个密码子位点ＡＴ的含量远髙于其它位点；６）Ｈ种昆虫线粒体基因组中ｎａｄ５、ｎａｄ６和ｃｏｂ基因的碱基置换率均小于１，说明它们受到负选择作用。已测定的同翅目中２７种昆虫为材料，采用最大似然法Ｍａｘｉｍｕｎ（ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ，ＭＬ）和贝叶斯推理法（Ｂａｙｅｓｉａｎｉｎｆｅｒｅｎｃｅ，ＢＩ）分析ｒＲＮＡ和ＰＣＧｓ两种数据集，构建２７种同翅目线粒体基因组序列系统发育关系。结果表明，基于ＰＣＧ

8、和一ｒＲＮＡ的２个数据集