基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因.doc

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1、基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因侯敏徐松杜悠雯黄昊李琬陈丽娜【摘要】目的挖掘潜在的心血管疾病(CVD)风险基因,为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考作用。方法根据人类信号转导网络、CVD密切相关的toll样受体(TLR)信号通路以及相关的表达谱信息,以网络motif及其包含的基因为研究对象,采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析。结果经分析结果得到21个潜在的CVD疾病风险基因,并且,通过文献证实,其中有12个为CVD相关的风险基因,由此可见,本研究采用的研究方法是有效的。结论对

2、我们所发现的潜在CVD风险基因进行深入研究,对阐明CVD的发病机制有重要的生物学意义。【关键词】心血管疾病;Toll样受体;信号转导网络;风险基因基金项目:哈尔滨医科大学大学生创新创业训练基金(2012-071HMU),国家自然科学基金(61272388),,黑龙江省自然科学基金(F201237)。作者单位:150081,哈尔滨医科大学生物物理教研室通信作者:陈丽娜,电话:0457-86674768,E-mail:chenlina@ems.hrbmu.cnFindingCVDrelatedriskgenesbasedonHumanSignalingTransdu

3、ctionNetworkandTLRSignalingNetworkHOUMin,XUSong,DUYou-wen,HUANGHao,LIWan,CHENLi-na.DepartmentofBiophysics,HarbinMedicalUniversity,Harbin150081,China.Correspondingauthor:ChenLi-na,E-mail:chenlina@ems.hrbmu.cn【Abstract】ObjectiveThepurposeofthispaperistofindthepotentialriskgenesofCardio

4、vascularDisease(CVD),whichwillprovidesomereferencefortheprevention、diagnosisandtreatmentofCVD.MethodsAccordingtotheHumanSignalingTransductionNetwork,TLRSignalingPathwayandarelatedexpressionprofiledata,thenetworkmotifanditsgenesweretakenastheresearchobject,themethodsofSignificanceAnal

5、ysisofMicroarrays,MotifScreeningandGeneSetEnrichmentAnalysis(GSEA)wereadoptedtoanalysethecandidategenes.Results21potentialriskgenesofCVDwerefound,12ofwhichwereconfirmedasCVDrelatedriskgenesbyreferences,whichshowsourstrategyisdependable.ConclusionsBiologicallyspeaking,thefurtherstudyo

6、fthepotentialriskgenesofCVDwehavefoundisimportanttoclarifythemechanismofCVD.【Keywords】CVD;TLR;Signalingtransductionnetwork;Riskgenes心血管疾病(CardiovascularDisease,CVD)是目前人类最常见的复杂疾病之一,也是发病率最高的一类疾病,其致病机理涉及多方面因素[1-2]。目前普遍认为CVD与巨噬细胞中脂质代谢障碍密切相关[3],脂质代谢障碍引起动脉管壁变脆、变硬,管腔变窄,形成动脉粥样硬化[4];泡沫细胞是动脉粥样

7、硬化斑块内出现的特征性病理细胞[5-6],在CVD的发病初期,有大量巨噬细胞转变为泡沫细胞,形成脂质条纹甚至脂质斑块,继而引发各种症状。但是,动脉粥样硬化的发病机理尚不完全清楚,仍然需要继续探索。有研究证实,巨噬细胞是参与检测病原体入侵和诱导免疫应答的一类免疫细胞,TLRs在巨噬细胞中发挥着重要的作用,也是动脉粥样硬化病变过程的重要调控因子[7],尤其在炎症发生的情况下,它对心血管疾病的的发生和发展有着重要的调控作用[8]。TLRs是主要的模式识别受体家族(PRRs)之一,是参与固有免疫的一类重要蛋白质分子[9]。CVD往往与信号转导通路中的信号传导障碍密切相关

8、[11],多个信号通路通

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