中国汉族人群缺血性脑卒中分子遗传学地研究

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1、万方数据DissertationSubmittedinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofDoctorofPhilosophyinGeneticsMoleculargeneticresearchofIschemicStrokeintheChineseHanPopulationPh.D.Candidate:XinXiongMajor:GeneticsSupervisor:QingWangXinTuHuazhongUniversityofScienceandTechnologyW

2、uhan,Hubei430074,P.R.China,Jan.,2014万方数据万方数据独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除文中已经标明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版

3、,允许论文被查阅和借阅。本人授权华中科技大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本论文属于保密□,在年解密后适用本授权书。不保密□。(请在以上方框内打“√”)学位论文作者签名:指导教师签名:日期:年月日日期:年月日万方数据万方数据华中科技大学博士学位论文摘要脑卒中是一种危害程度很高的脑血管疾病,它以一个飞速增长的模式正在全球蔓延开来,危害着全球数以百万计人类的健康。在中国,每年有超过两百万的新增脑卒中患者。脑卒中的病理机制非常复杂,它不是一个单一性的疾病,它可能

4、是一种常见的复杂疾病主要是由于遗传因素和环境因素而导致的。其中大血管脑疾病导致的卒中遗传率为40.3%,心源性疾病导致的脑卒中遗传率为32.6%,小血管疾病导致的脑卒中的遗传率为16.1%。而全基因组关联分析(GWAS)正是目前非常流行的研究复杂性遗传疾病的主要研究手段,它能够发现疾病的易感位点,找出致病基因,从遗传学上去解释发病机理,给临床预防和新药研制提供了有效的指导方向。通过GWAS研究或者病例-对照关联分析研究发现,与缺血性脑卒中相关的候选基因和位点包括MTHFR,PAL-1,TNF,APOA,APOE,ACE,FactorVL

5、eiden,ALOX5AP,Angiopoietin-1,CRP,CYP4AII,CYP4F2,CYPIIB2,DDAH1,NOS3,PCSK9,GP1BA,GPIIIa,IL-6,LTC4S2,MTHFR,NPY,PDE4D,SGK1,VKORC1,NINJ2,PRKCH,PITX2,ZFHX3和prothrombin基因。但是GWAS的研究策略还是具有一定的局限性,它只能解释低于20%的遗传可能性,更多新的位点或者遗传变异仍然需要探究。它无法全面地涉及到所有的种群和地域差异,因此在不同人群中进行验证的工作,也逐渐成为了研究的热点。这

6、些验证工作也是对GWAS的结果进行补充和完善,使数据更加真实可靠。本文的第一部分,是研究SNP位点rs1122608在中国汉族人群中与缺血性脑卒中的关系。SNPrs1122608位于19p13上的BRG1/SMARCA4基因里,它曾经在多篇文献中被报道与冠心病和心梗相关。而缺血性脑卒中和冠心病有着类似的发病机制,但是这个位点之前从并未发现与缺血性脑卒中相关。于是我们在中国-中部和中国-北方两个人群中对这个位点进行研究,其中中国-中部群体中我们选取了1,075缺血性脑卒中患者和2,685非缺血性脑卒中的对照人群,中国-北方群体我们选取了1

7、,208缺血性脑卒中患者和824非缺血性脑卒中的对照人群。结果显示,SNPrs1122608的小等位基因型T能够使中国人群中患缺血性脑卒中的风险降低。在中国-中部人群中,I万方数据华中科技大学博士学位论文-4,经过性别、年龄、高血压、吸烟史和脂质水平的矫正后的Padj=2.1×10OR=0.61,中-3,国-北方人群经过以上因素矫正后的Padj=6.00×10OR=0.69,当两个群体合并后的合-5,并群体矫正后的Padj=7.86×10OR=0.73。同时,rs1122608的小等位基因型T也能够降低中国汉族人群的总胆固醇水平(Pad

8、j==0.013)。接着我们通过eQTL的方法,试图阐明SNPrs1122608和基因表达水平的关系。我们首先用实时定量荧光PCR的方法检测SNPrs1122608与BRG1/SMARCA4基因和SNPrs

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