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《基于mtdna-coi基因序列分析我国中华按蚊种群的遗传结构》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、基础研究基于mtDNA-COI基因序列分析我国中华按蚊种群的遗传结构123451131常雪莲，钟代斌，李小聪，黄亚铭，朱国鼎，魏星，夏惠，陈晓光，方强12蚌埠医学院病原生物学教研室，安徽蚌埠233030；美国加州大学欧文分校健康科学院公共卫生部，加州尔34湾92617；广东普通高校新发传染病防治重点实验室，广东广州510515；广西壮族自治区疾病预防控制中5心，广西南宁530028；江苏省血吸虫病防治研究所，江苏无锡214064摘要：目的探讨我国中华按蚊种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系。方法本实验采用2010-2012年间在我国山东，安徽，江苏，贵州，广
2、西和云南等6个不同地理环境采集的中华按蚊样品，进行线粒体COI基因扩增并测序。采用Bioedit7.0软件对测序结果进行比对分析；运用DnaSP5.0软件确定种群遗传结构特点；应用Arlequin3.1软件计算种群的遗传距离及遗传分化系数；通过IBDWS在线软件来明确遗传距离与地理距离的相关性；使用PHYLIP3.6软件构建种群系统发育进化树。结果六个中华按蚊种群共123个雌蚊个体的PCR产物成功扩增和测序。PCR扩增中华按蚊线粒体COI基因序列大小为814bp，平均A+T含量（71.2%）>平均G+C含量（28.8%）。线粒体COI序列分析结果显示，种群具有丰富
3、的遗传多样性；分子变异等级分析表明中华按蚊遗传分化主要来自于种群内部；种群间存在一定的地理隔离现象。中性检验，错配分析及聚类进化树结果显示：中华按蚊种群发展经历扩张状态，而云南种群相对其他种群较独立，在系统树中为孤立一支。结论线粒体COI基因可以作为研究中华按蚊种群遗传结构和系统进化的理想分子标志。云南种群遗传发育较其他地理种群具有一定特殊性。关键词：中华按蚊；mtDNA-COI；种群遗传AnalysisofpopulationgeneticstructureofAnophelessinensisbasedonmitochondrialDNAcytochromeo
4、xidasesubunitIgenefragmentCHANGXuelian1,ZHONGDaibin2,LIXiaocong3,HUANGYaming4,ZHUGuoding5,WEIXing1,XIAHui1,CHENXiaoguang3,FANGQiang11DepartmentofMicrobiologyandParasitology,BengbuMedicalCollege,Bengbu233030,China;2PrograminPublicHealth,CollegeofHealthSciences,UniversityofCaliforniaatI
5、rvine,Irvine92617,USA;3KeyLaboratoryofPreventionandControlforEmergingInfectiousDiseasesofGuangdongHigherInstitutes,Guangzhou510515,China;4GuangxiZhuangAutonomousRegionCenterforDiseasesControlandPrevention,Nanning530028,China;5JiangsuInstituteofParasiticDiseases,Wuxi214064,ChinaAbstrac
6、t:ObjectiveTostudythepopulationgeneticvariation,geneticdiversityandphylogenesisofAnophelessinensisinChina.MethodsAnophelessinensissamplescollectedfromShandong,Anhui,Jiangsu,Guizhou,andYunnanProvincesandGuangxiZhuangAutonomousRegionwithdifferentgeographicalconditionsbetween2010and2012w
7、ereanalyzedbymitochondrialDNAcytochromeoxidasesubunitI(mtDNA-COI)geneamplificationandsequencing.Bioedit7.0andDnaSP5.0softwarewasusedtocomparethegenesequencesandanalyzethepopulationgeneticstructure,respectively.Arlequin3.1wasusedtocalculatethegeneticdistanceandparametersofpopulationdif
8、feren
