中国小黄黝鱼种群遗传结构和分化研究

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1、文章编号：１６７４５５６６（２０１７）０３０３５８０８ＤＯＩ：１０．１２０２４／ｊｓｏｕ．２０１６０５０１７７０中国小黄黝鱼种群遗传结构和分化研究郑新，李晨虹（上海海洋大学水产与生命学院，上海２０１３０６）摘要：小黄黝鱼（Ｍｉｃｒｏｐｅｒｃｏｐｓｓｗｉｎｈｏｎｉｓ）是广布于中国长江及北方各水系的一种小型淡水虾虎鱼类。本研究采集了来自松花江（哈尔滨）、辽河（沈阳）、海河（北京）、黄河下游（濮阳）、高邮湖、长江水系（邵阳资水、洪湖、荆州、靖江市、巢湖、太湖、郎溪、洞庭湖）和云南腾冲的８８个样品。通过分析线

2、粒体细胞色素ｂ（Ｃｙｔｂ）和控制区Ｄｌｏｏｐ基因序列的变异研究小黄黝鱼不同地理种群的相互关系，并探讨其遗传结构和物种分化。Ｃｙｔｂ和Ｄｌｏｏｐ的序列串联共得到６３个单倍型，１３３个变异位点。ＡＭＯＶＡ、ＳＡＭＯＶＡ、网络图以及贝叶斯建树分析结果都支持将其分为邵阳资水种群（Ａ种群）、太湖种群（Ｂ种群）、其他地区种群（Ｃ种群）３个差异较大的分支，其中Ｃ种群又大致可以分３个子种群。错配分布分析表明靖江（Ｆｕ’ｓＦＳ：－４．１１９，Ｐ＝０．００９）和洪湖（Ｆｕ’ｓＦＳ：－２．８１４，Ｐ＝０．０１６）两地的种群历

3、史上发生过种群扩张。关键词：小黄黝鱼；线粒体细胞色素；Ｄｌｏｏｐ；种群结构；单倍型网络图中图分类号：Ｓ９１７文献标志码：Ａ小黄黝鱼（Ｍｉｃｒｏｐｅｒｃｏｐｓｓｗｉｎｈｏｎｉｓ）隶属于鲈线粒体ＤＮＡ具有进化速率快、严格按照母［３４］形目（Ｐｅｒｃｉｆｏｒｍｅｓ）虾虎鱼亚目（Ｇｏｂｉｏｉｄｅｉ）沙塘鳢系遗传等特点，本文使用线粒体Ｃｙｔｂ和Ｄ科（Ｅｌｅｏｔｒｉｄａｅ）小黄黝鱼属（Ｍｉｃｒｏｐｅｒｃｏｐｓ），是一种ｌｏｏｐ基因位点分析不同水系小黄黝鱼的种群结构小型底栖淡水鱼类，为中国特有种，分布于长江和遗传分

4、化等方面问题。探讨小黄黝鱼种群可水系及其以北各大河流中，直至黑龙江。动物以分为几支，各支之间差异情况以及探讨小黄黝［１］志记载小黄黝鱼广泛分布于中国各大水系，但鱼遗传多样性及种群历史动态。经过野外采样调查和询问当地鱼类爱好者发现闽江、珠江水系均未发现小黄黝鱼，只发现萨氏华黝鱼（Ｓｉｎｅｌｅｏｔｒｉｓｓａｃｃｈａｒａｅ），这两种鱼形态和遗［２］传都有很大差别，动物志可能根据以前资料，把侧扁黄黝鱼（Ｈｙｐｓｅｌｅｏｔｒｉｓｃｏｍｐｒｅｓｓｏｃｅｐｈａｌｕｓ）误当作小黄黝鱼，侧扁黄黝鱼是萨氏华黝鱼的同物［１］异名

5、。目前还没有关于小黄黝鱼种群遗传的分子方面研究，其种群结构以及遗传多样性情况不明，比如小黄黝鱼分为几个地理种群、有效种群的大小及种群遗传多样性情况等有待研究。另外根据伍汉霖教授口述，他与易伯鲁教授曾经探讨中国西南地区小黄黝鱼与其它地区种群存在的形态差异，可能有隐秘种存在，但也未有文图１小黄黝鱼样本采集地点章报道（伍汉霖，个人通讯）。Ｆｉｇ．１ＳａｍｐｌｉｎｇｓｉｔｅｓｏｆＭ．ｓｗｉｎｈｏｎｉｓ收稿日期：２０１６０５１０修回日期：２０１６０７３１基金项目：上海市教育委员会科研创新项目（Ｂ２５３０８

6、１３０４５５）作者简介：郑新（１９８９—），男，硕士研究生，研究方向为分子系统发育。Ｅｍａｉｌ：９１９１７８６６３＠ｑｑ．ｃｏｍ通信作者：李晨虹，Ｅｍａｉｌ：ｃｈｌｉ＠ｓｈｏｕ．ｅｄｕ．ｃｎ３期郑新，等：中国小黄黝鱼种群遗传结构和分化研究３５９江市（ＪＪ）、巢湖（ＣＨ）、太湖（ＴＨ）、郎溪（ＬＸ）］、云１材料与方法南腾冲（ＴＣ）。本文每个采样点使用样品数量较１．１样本采集少，但是如洞庭湖、洪湖、荆州的采样点相距较小黄黝鱼样本采自１４个地区共８８尾（表１，近，都属于洞庭湖周边水系，因此同一水系的样图１）

7、，分别采自松花江（ＳＨＪ）哈尔滨、辽河本数量充足。样本经鉴定后，取新鲜肌肉保存于（ＬＨ）沈阳、海河（ＨＨｅ）北京、黄河下游濮阳９５％的乙醇中。标本现存于上海海洋大学标本（ＰＹ）、高邮湖（ＧＹＨ）、长江水系［邵阳资水室。（ＳＹ）、洞庭湖（ＤＴＨ）、洪湖（ＨＨ）、荆州（ＪＺ）、靖表１小黄黝鱼的样本信息及各种群遗传多样性Ｔａｂ．１ＳａｍｐｌｉｎｇｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｎｄｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＭ．ｓｗｉｎｈｏｎｉｓ单倍型多样性核苷酸多样性采样点坐标水系样本数单倍型数单倍型Ｈａｐｌｏｔｙｐ

8、ｅｓＮｕｃｌｅｏｔｉｄｅＳａｍｐｌｅｓｉｔｅＣｏｏｒｄｉｎａｔｅｓＤｒａｉｎａｇｅＳａｍｐｌｅｓＨａｐｌｏｔｙｐｅｓＨａｐｌｏｔｙｐｅ（Ｈ）ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ（ｈ）ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ（π）１安徽郎溪（ＬＸ）Ｅ１１９°０２′Ｎ３１°１１′长江水系６４１０，４９，５０，５１０．８０００±０．１７２１０．００８７０８±０．００５２１１２浙江湖州太湖（ＴＨ）Ｅ１１９°９４′Ｎ３１°２１′长江水系６５０６，０７，０８，０