天花粉蛋白和马氏蝎毒分子的结构和功能预测

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1、№要嘶之孓"i166G1计算生物学是一门新兴的边缘学科，它的主要任务之一就是对未知的生物学领域进行预测和根据给定的目标用计算机进行设计。随着计算机技术的飞速发展，计算机实验改变了传统的理论和实验之间的关系。一方面，计算机模拟增强了对模型准确性的要求，另一方面，模拟也可以和实验条件很相似，以致于计算结果可以直接和实验结果相比较a用分子动力学模拟和静电学计算研究天花粉蛋白在120—123位的定点突变行为。结果揭示了在突变区附近静电特性和局域构象上明显的变化中提出了有关突变的一个可能的物理学的解释。结果建议R122残

2、基对120—123活性区是至关重要的。正是定向的静电力导致底物与天花粉结合，静电场影响此对接过程的初始导向。突变使活性丧失可主要归结于在天花粉活性沟区中此静电场方向性的丧失。用同源模建对马氏钳蝎中的一种新的a型昆虫神经毒素(BrnKo【ITl)的三级结构进行了计算。BmKcdTl与其受体间的相互作用估计是纯静电性的。、，、关键词静电；活性：突变：分子模建CLCNumber：Q617ABSTRACT：Modelingproteinmolecularwithcomputerisanewarea．Themostimp

3、ortworkofitispredictanddesignthestructurewhichwasgaveWiththeadvanceofcomputertechnology，computerexperimentchangedtherelationshipbetweentraditiontheoryandexperiment．Inawords，computersimulationenhancetherequirrnentoftheveracityofmodel．Inotherwordssimulatecansi

4、militudewi血experiment，sothattheycanbecamparedeachother．Moleculardynamicssimulationandelectrostaticcalculationareusedtoinvestigatethesite—directedmutagenesisofTficho，santhinproteininthepositionof120to123supportedbyexperimentsResultsrevealtheconsiderablechange

5、sinelectrostaticpropertiesand10calconformationnearthemutatedre#onofTrichosanthin．ItissuggestedthattheR122iscrucialintheactiveregionof120—123andthedirectionalelectrostaticforcedrawssubstratestogetherwithTrichosanthin．Theelectrostaticfieldinfluencestheinitialo

6、rientationinthedockingprocess．Thelosingofactivityaftermutationcanmainlybeconcludedtobethelosingofdirectionalityofelectrostaticfieldintheactivegrooveregion．Athree-dimensionalstructureofanewinsect—selectivea．neurotoxinrBmKcdTllofscorpionButhusmartensiKarschwas

7、computermodeledusinghomologymodeling．Recently。TheinteractionbetweenBmKalTIanditsreceptoristhoughttobepurelyelectrostatic．KeyWords：Electrostatics；Activity；mutation；molecularmodelingCLCNumber：Q617前言现在，分子生物学中心法则中由DNA到RNA再到多肽链合成的过程已经基本清楚，但以一定氨基酸顺序排列的多肽链是如何形成一定空间

8、结构的蛋白质分子的，仍然是一个迷。同时，由于人类基因组计划人类全部基因图谱的完成，生物学的重点已经逐渐转向蛋白质结构和功能的研究上去了。计算生物学是-r3新兴的边缘学科，它的主要任务之一就是对未知的生物学领域进行预测和根据给定的目标用计算机进行设计。随着计算机技术的飞速发展，计算机实验改变了传统的理论和实验之间的关系。一方面，计算机模拟增强了对模型准确性的要求，另一方面，模拟常常可以和