遗传学实验中ssr标记的应用实践

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1、遗传学实验中SSR标记的应用实践　　摘要：该实验是科研成果转化为实验教学设计的一个成功案例，建立了植物DNA指纹检测和父本鉴定技术。通过本实验，学生可以掌握PCR技术、DNA提取和电泳检测等实验技术，巩固关于基因位点/等位基因、纯合体/杂合体、二倍体/三倍体、孟德尔遗传规律和DNA指纹图谱等多个（对）重要的遗传学概念，提高学生学习遗传学的兴趣。　　关键词：遗传标记遗传学实验SSR枣树分子遗传　　ApplicationandpracticeofSSRmarkerintheteachingofgeneticsexperiment　　PangXiaoming，LiYingyue　　Be

2、ijingforestryuniversity，Beijing，100083，China　　Abstract：Thewell-designedexperimentisasuccessfulcaseofmakingfulluseofscientificresearchachievementsintheteachingofgeneticexperiment，whichincludestheexperimentofDNAfingerprintingconstructionandpaternityanalysisoftheseedlings.Throughtheexperiment，th

3、estudentswillhavetheexperienceofPCRtechnology，DNAisolationandtheseparationofDNAbydifferentmethods.Furthermore，theinvolvementintheexperimentwillhelptostrengthenseveralimportantconceptsinthegeneticsincludinggenelocus/allele，8heterozygosity/homozygosity，diploid/triploid，theMendelianinheritancela

4、wsandDNAfingerprintingetc.Takentogether，theexperimentwillbeimportanttoinvoketheinteresttolearnthecourseforthestudents.　　Keywords：geneticmarker；geneticexperiment；SSR；jujube；moleculargenetics　　“DNA指纹”是指可以利用DNA差异来进行与传统指纹相似的个体身份识别。DNA指纹是以DNA的多态性为基础。SSR（Simplesequencerepeat，简单重复序列），又称微卫星DNA，一般是由2～

5、6个核苷酸碱基组成的基序并串联而成的DNA序列，在真核生物基因组中广泛存在。SSR标记具有多态性高、实验操作简单、稳定性好、可重复性高、对DNA模板质量和数量要求均较低的共显性标记，现广泛应用于亲本分析、遗传多样性研究、指纹图谱和遗传图谱构建等方面，是一种目前发展较为成熟的分子标记技术[1]。　　在植物的遗传及育种试验和实践中（如实生选种中），获得的子代苗母本来源是确切知道的，但经常缺乏父本信息。利用共显性分子标记技术结合统计分析方法可以帮助我们寻找可能的父本来源。父本分析（Paternityanalysis）对了解群体间或世代间的基因流动及性别选择适合度有重要的理论意义[2]。

6、SSR的高分辨力及其共显性遗传特点使其成为杂交种亲本鉴定使用最多的标记。8　　常用的父本分析方法包括排除分析法、最大似然性分析法和父性拆分法等，在植物群体中利用亲本排除法进行父本分析的例子较多[2]。排除分析法根据孟德尔遗传规律检测母本与可疑父本基因型组合能否产生子代基因型，否则排除相应可疑父本。另外，也可以利用软件Cervus3.0进行分析。Cervus3.0是一款使用共显性标记的软件，是Marshall于1998年开发的，这款软件可以鉴定单亲本未知或双亲本未知的情况，基于最大似然法进行亲本分析，通过等位基因频率来计算各个非排除父本作为亲生父本的概率，进而确定最大可能的父本。用

7、LOD值来进行结果分析。由于便于操作，是目前最普遍应用的亲本分析软件[3]。　　该实验是体现遗传学原理和技术在生产和生活中应用的例子，可达到巩固和学习如下重要知识点的目的：（1）通过提取枣树DNA，熟悉植物DNA的提取步骤；（2）巩固分离定律和自由组合定律的学习；（3）巩固PCR技术原理；（4）通过SSR标记的检测，掌握SSR标记的原理、检测技术和应用；（5）通过二倍体和多倍体基因型差异，巩固复等位基因和基因座等概念；（6）学习利用SSR标记进行亲子鉴定的原理和技术。学生通过实验