肉毒毒素e型重链的生物信息学分析

肉毒毒素e型重链的生物信息学分析

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1、从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果肉毒毒素E型重链的生物信息学分析中国编辑。作者:赵国杰,郝凤进,关一夫【摘要】目的:分析肉毒毒素E型重链的抗原表位及空间结构。方法:利用在线生物信息学分析工具以及其它分析软件分析重链蛋白的抗原表位和空间结构。结果:预测并显示了肉毒毒素E型重链的空间结构图,以及9个可能的重链的B细胞抗原表位,静电势图揭示了重链分子结构域的两性特点。结论:抗原表位的预测对于E型肉毒毒素相关诊疗试剂的开发有指导意义,而结构域的极性分析提示其等电点的不同可能在pH介导的穿膜中起了作用。

2、【关键词】肉毒毒素类;抗原;表位,B淋巴细胞;氨基酸序列;基因重排,B淋巴细胞,重链BioinformaticAnalysisofBotulinumNeurotoxin[Abstract]Objective:ToanalyzebotulinumneurotoxintypeEheavychain(BoNT/EHC)antigenepitopesanditsspatialstructure.Methods:Onlinebioinformaticanalysistoolsandsomeotheranalysissoftwareswereused.Results:Tertiarystructureof

3、BoNT/EHCchainwasanticipatedanddemonstrated.NinepossibleantigenepitopesoftheHCwerepredicted,andelectricalpotentialmaprevealedtheamphoteric课题份量和难易程度要恰当,博士生能在二年内作出结果,硕士生能在一年内作出结果,特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果domainsoftheHC.Conclusions:Thepredicting

4、ofantigenepitopesisofimportancetotheexploitingofBONT/Erelatedagents,anddomainanalysissuggestsdomain′spIisimportanttopHmediatedmembrane-passing.[Keywords]botulinumtoxins;antigens;epitopes,B-lymphocyte;aminoacidsequence;generearrangement,B-lymphocyte,heavychain 肉毒毒素是肉毒梭菌分泌的外毒素,具有抑制外周神经末梢释放胆碱神经递质,麻痹肌肉的

5、毒性作用,微克量级的毒素可致成人死亡,它被认为是已知的毒性最强的物质。肉毒毒素根据血清型分为A、B、C、D、E、F和G7个类型,对人类常见的致病血清型主要是A、B和E型。对于肉毒毒素的结晶和结构分析的相关研究主要集中在A、B两型,而且各型抗原性差别主要在于重链,尤其是受体结合结构域。XX-XX年,利用生物信息学技术,对E型重链的三级结构以及抗原表位进行了分析,判定其潜在的抗原表位,为E型肉毒毒素相关的诊疗试剂的开发提供理论依据。同时,在肉毒毒素中毒机理的相关研究中,分析了BoNT/E课题份量和难易程度要恰当,博士生能在二年内作出结果,硕士生能在一年内作出结果,特别是对实验条件等要有恰当的估计。

6、从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果HC的不同结构域的等电点,绘制出三维的静电势图像,显示了组成HC的2个结构域的酸碱双极性,提示在pH诱导的穿膜机制中,这种不同亚基的等电点和静电势的差异是重要的分子理化基础。1材料与方法BoNT/EHC蛋白的氨基酸序列及结构分析 从NCBI网站GenBank获取全长BoNT/E型肉毒毒素的氨基酸序列[1]。第一位M翻译后被切去,其全长共151个aa,近前1/3位置处的G419-R421三肽被蛋白酶切去后,单链蛋白分为轻重2条肽链,其中重链编码830个氨基酸,轻链

7、编码418个氨基酸[2]。轻链和重链通过二硫键而连接在一起。重链的氨基酸序列如图1所示。BoNT/EHC的基本理化性质使用anthewin软件分析BoNT/EHC全长,以及2个各约50kD的结构域,即重链N末端的跨膜转运结构域HN(K1~Y408)和重链C末端的神经细胞特异性结合结构域HC(T409~K830)的等电点。BoNT/EHC的抗原表位预测 使用anthewin软件系统分析,采用其中的G

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