基于文献挖掘的中医证候生物学基础初步研究

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1、从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果基于文献挖掘的中医证候生物学基础初步研究　　中医学的基本特点在于整体观和辨证论治，以病证结合、方证相应，即“病证方”结合的诊疗模式为特色。证的生物学基础则是中医药现代化的关键，目前研究较多的有血瘀证、肾阳虚证、寒证、热证等，并形成了证本质研究、证实质研究、证候客观化等多个学术生长点，如阴黄证和阳黄证的代谢组学发病机制[1]，为阐释中医证候的生物学本质，证的诊断客观化、规范化和病证分型治疗提供依据。　　基金

2、项目：国家自然科学基金面上项目；北京市青年英才计划　　通讯作者：陈建新，E-mail：Cjx@　　气虚证是中医常见证型，可见于研究深入的几大疾病中，如冠心病、心力衰竭、糖尿病等[2-7]，临床常见检验方法已对上述疾病进行诊断。研究表明，这些常见病与神经-内分泌-免疫密切相关[8]。本研究以NEI网络相关基因为基础，以气虚证为切入点，通过文献挖掘方法初步得到了气虚证基于NEI网络特有的生物活性物质，对阐明证候的客观性，揭示证候、疾病中分子相互作用机制有着重要意义，为揭示证候的科学内涵奠定了方法学基础。　　1资料与方法　　收集表征术语关键词

3、课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果　　以中华人民共和国国家标准《中医临床诊疗术语》为主要依据收集、整理出11个“气虚证”的表征术语关键词，包括气虚、隐痛、钝痛、气短、乏力、神疲、懒言、头晕、自汗、舌淡、脉虚。　　1.文献挖掘方法　　从dbNEI数据库上下载NEI相关基因，载入Genclip软件中，然后使用该软件的“Wordrel

4、atedGeneSearch”功能在文献库中挖掘与给定表征术语相关的NEI基因，并使用“LiteratureMiningGeneNetworks”功能构建气虚证每个表征术语的基因网络。分别比较挖掘出的与气虚证各关键词相关的基因，找出同时出现在2个关键词及以上的那些基因，由于这些基因至少同时在某一证候的2种表征中出现，那么，他们就很可能与该证候有一定联系而非只和单一表征有关，即与气虚证有联系。　　1.基因分析方法　　应用DAVIDBioinformatics软件[9]对所得基因进行分层聚类、基因类型测试和KyotoEncyclopedia

5、ofGenesandGenomes通路分析。基因聚类测试是一种探索性的工具，用以探索检测基因表达数据内部的关联性，为进一步考虑进行假设性的筛选。KEGG通路分析可以帮助寻找所提供基因所参与的生物过程。　　结果课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果　　文献挖掘结果显示，气虚的11个关键词中有5个挖掘出与之相关的基因，具体关键词及挖掘出

6、的基因个数见表1；通过比较气虚证与各个关键词相关的基因，找出了15个同时出现在2个关键词及以上的基因，见表2。脉虚、自汗、头晕、气虚关键词基因网络见图1。　　表1气虚证关键词对应的基因数目　　关键词基因个数　　气虚1　　呼吸困难5　　头晕3　　脉虚　　自汗联盟　　表同时出现在2个表征术语及以上的基因　　编号气虚基因出现次数　　1IL6　　IL10　　IL2　　IL1B　　续表2　　编号气虚基因出现次数　　IFNG　　POMC课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从

7、本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果　　ADIPOQ　　IL8　　IL2　　10CD12　　11CD79A　　1FGF2　　1CD40LG　　1NPPB　　1LEP　　脉虚自汗　　气虚　　头晕　　图1气虚证关键词基因网络　　讨论课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特

8、别是博士生必须有创新性的成果　　1973年，Isakovi?[10]和Jankovi?[11]通过双边对称电解损伤大鼠大脑不同部位，并观察其对淋巴器官的影响后，首次提出了NEI三大系统之间的关系。NEI网络