cytoscape软件画图说明书

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时间:2018-12-27

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1、Cytoscape软件画图说明1、画图前,先准备两个输入文件。2、打开cytoscape软件,导入数据。导入edge.txt文件点击File----Import----Network连接类型,文件中第3列节点1,文件中第一列节点2,文件中第2列点击ok得到原始图形点击layout----ApplyPreferredOut改变图形排列方式此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。改变画布背景。点击左侧ControPanel----Style---network---Backgroudpaint设置节点之间连线的宽度和颜色ControPa

2、nel----Style---Edge颜色宽度导入node.txt个文件点击File----Import----Table设置节点图形属性ControPanel----Style---Node1、node大小通过设置Height和Width来控制大小2、Node性状通过设置Shape来控制3、Node填充色通过设置FillColor来控制4、Node标签的设置点击Properties--LabelPosition点击LabelPosition来设置标签位置。这里是一个示范操作,要细致调整标签位置还是要设置Column和MappingTy

3、pe两个参数。设置完成之后图形调节节点之间的距离点击layout----Scale鼠标拖动最后,画图导出成pdf文件点击File----Export----NetworkViewasGraphics

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