ssr相关基础知识

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1、共显性:很多已图谱类分子标记都是共显性,简单说就是基因型AA,Aa,aa都能在图谱中区分开来,A和a是两条不同大小的带。复杂点说就自己查阅下文献吧。高度重复性:高度重复是,说重复单元的重复次数是多变的,因此多态性较强,可以用来进行多样性分析,群体遗传分析等(应该是指重复单元次数较多,所以为高度重复,卫星DNA都是这个特点,当然要说实验结果为高度重复也是有道理,但措辞不适应,实验结果只有重复性好或者重复性不好,基本不上实验结果高度重复,所以高度重复指前者的意思可能性更大。当然,像这种成熟的分子标记技术实验结果

2、肯定都是重复性好的。)可靠性:说试验的重复比较好,比较稳定。不想RAPD那样,今天出来了,明天就可能不行了期望杂合度He是理论计算得出的杂合度。观测杂合度是随机抽取的两个样本的等位基因不相同的概率。计算公式如下:观测杂合度(Ho)=观察得到杂和个体数/样本个体数杂合度编辑本词条缺少概述、信息栏、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!1.一般杂合度是指由所有标记检测到的两亲本间的差异程度,而特殊杂合度是指根据单因子方差分析所确定的对某一性状有显著效应的标记(阳性标记)计算的亲本间差异程

3、度2.杂合度是指随机抽取的样本中其两个等位基因不相同的可能性(Nei,1975)。期望杂合度主要是根据种群内当前优势等位基因的分布频率来推算的,稀有基因的贡献极其微弱3.遗传学上的杂合度,用H表示:杂合性的一种状态程度,反映一个位点具有两个以上等位基因的状态:H=1-Σpi期望杂合度是理论计算得出的杂合度。观测杂合度是随机抽取的两个样本的等位基因不相同的概率。计算公式如下:观测杂合度(Ho)=观察得到杂和个体数/样本个体数总数。预期杂合度值(He)根据Nei(1978)提供的公式计算:nHe=1-∑pi2i

4、=1其中pi是第i个等位形式的频率,所有位点的等位形式频率由软件POPGENE32计算得出,n是等位形式的数目。He值的范围从0(说明无多态性)到1(说明无限多个等位形式具有相同的频率,是个极限值多态信息含量是指DNA的多态性指标等位基因数是反映群体遗传变异大小的一个指标,其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数,表明等位基因在群体中分布越均匀。(最后一个是同源染色体上的)有效等位基因数是反映群体遗传变异大小的一个指标,其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数,表明等位基因在群体中分布越均匀。等位基因(alle

5、le):位于一对同源染色体的相同位置上控制某一性状的不同形态的基因。不同的等位基因产生例如发色或血型等遗传特征的变化。等位基因控制相对性状的显隐性关系及遗传效应,可将等位基因区分为不同的类别。在个体中,等位基因的某个形式(显性的)可以比其他形式(隐性的)表达得多。有效等位基因数编辑本词条缺少信息栏、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!中文名称有效等位基因数英文名称effectivenumberofallele定  义理想群体中(所有等位基因频率相等),一个基因座上产生与实际群体中相

6、同的纯合度所需的等位基因数。它等于实际群体的纯合度的倒数。等位基因频率编辑本词条缺少信息栏、名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧!等位基因频率是群体遗传学的术语,用来显示一个种群中基因的多样性,或者说是基因库的丰富程度。目录1概念2概念比较▪相关计算▪摘要▪理想状态▪自然状态3遗传平衡4高考信息5特殊情况1概念编辑等位基因频率是群体遗传学的术语,用来显示一个种群中基因的多样性,或者说是基因库的丰富程度。等位基因频率的定义如下:如果1)一个染色体中存在某特定基因座,2)该基因座上有一个

7、基因,3)一个种群中的每一个个体的体细胞都有n个该特定基因座(例如二倍体生物的细胞中有两个该特定基因座),4)该基因有等位基因或变种;那么等位基因频率为-------等位基因在这个种群中所有该等位基因在特定基因座中所占的百分比。举例来说,如果在某种群中一个等位基因的基因频率为20%,那么在种群的所有成员中,1/5的染色体带有那个等位基因,而其他4/5的染色体带有该等位基因的其他对应变种--可以是一种也可以是很多种。如人们熟悉的人的MN血型,它是由一对共显性等位基因M和N所决定,产生3种基因型M/M、M/N和

8、N/N,而相应的表型是M、MN和N,而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。这个原理可以推广到一般群体内婚配,如以群体中MN表型(基因型)的具体样本数被所观察到总数相除即可得到(转换)相对频率数。2概念比较编辑基因频率是某种基因在某个种群中出现的比例。基因型频率是某种特定基因型的个体占群体内全部个体的比例。前者是某基因个体数占全部基因数的比例,后者是某基因型个体数占群体总数的比例。相关计算⑴设二倍体生物个体的某

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