大肠杆菌高活性氨基酸生物的合成途经地地研究

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1、实用标准文案研究目的:汽油替代品:高能量密度、低吸湿性、辛烷值传统生物燃料&高级醇;直链醇&支链醇研究菌体:大肠杆菌方法技术:代谢工程:高活性氨基酸生物合成途经+埃利希途径(Ehrlichpathway)葡萄糖→2-酮酸中间体→高级醇(异丁醇、1-丁醇、2-甲基-1-丁醇、3-甲基-1-丁醇和2-苯乙醇)实验部分:一、异丁醇前期实验:1)2-酮酸是氨基酸生物合成途径的中间产物;通过2-酮基酸脱羧酶(KDC)转化为醛;通过醇脱氢酶(ADH)转化为醇类。通过实验,测定Kivd是所有测试酶中活性最高且最具有多样性的K

2、DC,ADH选用乙醇脱氢酶2,二者均来自酵母菌。精彩文档实用标准文案2)不同种类的2-酮酸(表2)加入到表达Kivd的大肠杆菌培养菌中会将相应醇类的产量提高2~23倍。特种2-酮酸的供应也明显地削减了其他醇类的产量。这些结果均表明增加特种2-酮酸的量可以提高醇类的产量和选择性。大肠杆菌已有的代谢途径被转基因改造,增加特种2-酮酸的产量,可以生产出期望的醇类。设计菌株:1)为合成异丁醇,质粒内PLlacO1启动子控制的ilvIHCD基因被过度表达以增大2-酮异戊酸生物合成量。2)强化ilv合成途径和乙醇合成途径(

3、Kivd和Adh2)。菌株可产生出23mM异丁醇,这约是普通菌株产量的五倍3)进一步提高异丁醇的产量,需要删除控制合成副产物的基因,包括adhE,ldhA,frdAB,fnr和pta。这些基因的删除可提高用于ilvIHCD合成途径的丙酮酸的量。敲出基因后的菌株产生了30mM异丁醇。4)选用枯草芽孢杆菌的alsS基因取代大肠杆菌的ilvIH基因。相比于大肠杆菌更偏向酮丁酸的ilvIH基因,alsS基因对丙酮酸盐有更强的亲和力。采用alsS途径的菌株可产生约50mM的异丁醇。5)为进一步增加丙酮酸盐的量,pflB基

4、因被敲出。在这些操作的综合作用下,可以在微好氧条件下使异丁醇的产量达到约300mM(22g/l)。实验结果:通过此种方法由葡萄糖获得了高产量、高选择性的异丁醇二、正丁醇1)1-正丁醇的前提2-酮基戊酸乙酯不是大肠杆菌的代谢物。,作者尝试以与亮氨酸生物合成途径相似的方法,以一种分子比2-ketovalerate少一个甲基的更小的分子——2-酮丁酸为底物,合成2-ketovalerate。2-酮丁酸可以通过由ilvA基因编码的苏氨酸脱水酶作用苏氨酸生成。2)为进一步提高1-丁醇的产量,编码二羟酸脱水酶的基因ilvD

5、被敲除。二羟酸脱水酶能够同时产生2-酮基异戊酸(亮氨酸和缬氨酸的前体)和2-酮基3-甲基戊酸(异亮氨酸的前体)。此种操作有两个优点:首先,ilvD基因的敲除避免了leuABCD代谢途径的自然底物2-酮基异戊酸的生成,进而抑制了目的产物的竞争底物。其次,ilvD基因的敲除避免了Kivd的竞争底物2-酮酸-3-甲基-戊酸和2-酮酸-4-甲基戊酸的产生。故而ilvD基因的敲除进一步增加了1-丁醇的产量。三、提高耐受性为了探索耐受性的可提高程度,我们对于正丁醇耐受性的菌株进行传代培养。我们发现,原生的大肠杆菌对于正丁醇

6、的耐受性为1.5%。然而,菌株在正丁醇浓度不断增加的环境下进行传代培养五代之后,便会出现对正丁醇的耐受性达到2%的基因突变菌株(补充材料中的图4)。这种菌株的耐受性可达到与1-丁醇的原生生产者相当或甚至优于原生生产者。证明大肠杆菌可以适应长链醇类的高浓度环境。之后还可以运用诸如全转录工程(gTME)等其他的方法进一步提高耐受性。精彩文档实用标准文案优势:1、本方法使用大肠杆菌作为研究菌体,但这种方法可以在诸如酿酒酵母菌的其他温和菌体上实现。这些寄主微生物生长速率快,且为兼性厌氧菌,这为大规模生产提供了可操作性和

7、经济上的可实现性。2、这种方法摒弃了辅酶A介导的化学这种在原生微生物中生产醇类物质的普遍化方法,使得合成其他分子量更大、更复杂的醇类成为可能。精彩文档

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