大肠杆菌r基因克隆载体地构建与鉴定

大肠杆菌r基因克隆载体地构建与鉴定

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时间:2018-12-14

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1、实用标准文案大肠杆菌R基因克隆载体的构建与鉴定[摘要]DNA的重组与转化是分子生物学的基本实验操作。本实验可分为质粒DNA提取与鉴定,目的片段扩增与鉴定,DNA重组与转化三部分。本次实验可以全面提高学生的实验技能与逻辑思维,对于分子实验技能的培养具有重要意义。[关键词]DNA重组;转化;分子实验基本操作大肠埃希氏菌是常用的实验菌种,其质粒R-pGEX-4T-1为人工设计,已加入R目的基因片段。现需要将R基因转到pMD18-TSimpleVector载体质粒上,并将目标质粒转化入大肠杆菌感受态细胞,并检验转化效率。1材料与方法1.1材料1.1.1菌株及质

2、粒E.coliDH5α;R-pGEX-4T-1质粒;pMD18-T载体。1.1.2主要试剂和仪器溶液Ⅰ,溶液Ⅱ,溶液Ⅲ,TE缓冲液,0.5MEDTA,5*TBE,氯仿:异戊醇(V:V,24:1),70%乙醇,50mg/mLCarb,10*loading-buffer,2.5mmol/LdNTP混合物,Taq酶,DNA模板,引物对,10*PCRbuffer,50*TAE,0.1MCaCl2溶液,LB固体/液体培养基,5mg/mlTet,34mg/mlCam,3MNaAC,10mg/mLX-gal,200mg/mLIPTG(以上常规试剂全部按照《分子生物学实验

3、指导》要求配制);恒温摇床,台式离心机,高压灭菌锅,凝胶成像仪,琼脂糖凝胶电泳系统,PCR热循环仪,低温离心机,超净工作台。1.2方法1.2.1质粒DNA提取向含Carb(100μg/mL)的LB液体培养基中接入含R-pGEX-4T-1质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。质粒DNA用碱裂解法制备,具体步骤参照《分子生物学实验指南》。用1%琼脂糖凝胶电泳验证质粒提取结果。1.2.2质粒DNA双酶切及鉴定运用XhoⅠ酶与EcoRⅠ酶对上述步骤中提取的质粒R-pGEX-4T-1进行双酶切,酶切反应体系参见表1(如下),37℃反应1.5小时。并用1%琼脂糖凝胶电泳

4、验证酶切结果。1.2.3目的DNA片段的扩增与纯化精彩文档实用标准文案根据质粒R-pGEX-4T-1的序列,设计一对R基因引物(表2)用于R基因的扩增。PCR反应体系以质粒DNA为模板,用25μL反应体系进行扩增(表3),反应条件:94℃预变性5min,94℃变性40sec,55℃退火50sec,72℃延伸50sec,重复30个循环,72℃延伸8min。PCR产物经琼脂凝胶电泳图像分析鉴定,并按照胶回收试剂盒步骤,割胶纯化,回收PCR产物,-20℃低温保存。表1酶切反应体系表3PCR反应体系表2扩增R基因所用引物1.2.4DNA重组与转化用CaCl2处理大

5、肠杆菌,制备感受态细胞,具体步骤参照《分子生物学实验指南》。按照表4构建连接重组体系,16℃连接反应30min,制备重组质粒。将5μL连接产物加入至200μLDH5α感受态细胞中,冰中放置30min;热激,恢复性培养后去上清涂布于含有X-gal、IPTG、Amp的LB琼脂平板培养基,倒置平皿37℃培养过夜(12~16h),形成单菌落,计数白色、蓝色菌落。表4质粒连接重组体系pMD18-TSimpleVector(50ng/μL)0.5μLInsertDNA(0.1pmol~0.3pmol)3μLddH2Oupto5μLLigationMix5μL总体积10

6、μL2结果2.1质粒DNA提取结果鉴定2.1.1质粒提取后,1%琼脂糖凝胶电泳。(实验结果图缺失)精彩文档实用标准文案2.1.2质粒双酶切二次鉴定,1%琼脂糖凝胶电泳(如图一)显示出特异性条带说明质粒中确含有R基因,质粒提取成功。M:DL2000maker;1:双酶切结果产物M:DL2000maker;1:R基因PCR产物图一质粒R-pGEX-4T-1双酶切鉴定结果图2R基因PCR鉴定结果2.2目的DNA片段的扩增鉴定用所设计的引物对目的片段R基因进行克隆,得到R基因(600bp)(如图二)条带清晰、亮度高,证明PCR结果较为理想。2.3DNA转化结果鉴定

7、本部分实验结果不成功,培养基表面涂花,无单菌落长出。3讨论细菌质粒的获取,与DNA重组与转化,是分子生物学的基本实验操作。在本次实验中。成功实现了质粒DNA的提取与鉴定,目的基因的克隆与鉴定,细菌感受态细胞制备与质粒DNA重组与转化。在实验中,也有操作不理想之处。分析DNA转化鉴定没有结果的原因,有以下几点:Amp可能加入过早,未待平板冷却,导致加入的Amp失活,故没有Amp抗性的培养基上长满了菌,而不出现白色的单菌落;烧热的涂棒未冷却便进行菌液涂布,导致培养基表面融化;菌液未充分混匀,平板菌落分布不均等。[参考文献][1]魏群,2007.分子生物学实验指

8、导.高等教育出版社.75—96[2]高小焕,邵世和,段秀杰,谢立苹

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