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1、应用cDNA芯片技术筛选胰腺癌相关基因发表吋间：2009-8-2517:32:52浏览次数：145来源：创新医学网推荐蒋业樹1，李兆申2,王宇明1，刘同华3(1第三军医大学两南医院全军感染病研究所，重庆400038;2第二军医火学长海医院消化科，上海200433;3第三军医大学新桥医院药剂科，重庆400037)提耍:11的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14000种人类基因PCR产物用CartesianPix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上，制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA
2、,将等觉的RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA-•链做探针，混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像，每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的氣获得的荧光信号图像用计兑机分析。结果按差异显著性标准，从14000条基因屮筛选出在胰腺癌组织屮共同差异表达S因189条，其屮己知基因101条，新基因88条。在筛选出的己知基因中，冇50条表达上调，51条表达下调，包括原癌及抑癌基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架和运动蛋白相关基因、细胞凋亡和应激反应相关基因、DNA合
3、成和修复相关基因、转录因子类基因、细胞受体相关棊因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因等。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通泉筛选胰腺癌相关基因，并岛效对基因功能进行研宄。胰腺癌基因表达谱的分析冇助于认识肿瘤发病机制。关键词:腆腺癌;cDNA芯片;基因表达谱中图法分类号:R319;R394-33;R735.9文献柘识码:AScreeningthehumanpancreaticcancer-associatedgenesbycDNAmicroarrayJIANGYe-gui1,LIZhao
4、-shen2,WANGYu-ming1,LIUTong-hua3(1InstituteofInfectiousDiseases,SouthwestHospital,ThirdMilitaryMedicalUniversity,Chongqing400038;2DcpartmcntofGastrocntcrology,ChanghaiHospital,SccondMilitaryMcdicalUnivcrsity,Shanghai200433;3DepartmentofPharmacy,XinqiaoHospital,ThirdMilitar
5、yMedicalUniversity,Chongqing400037,China)Abstract:ObjectiveToscreenthehumanpancreaticcancer-associatedgenesbycDNAmicroarray.MethodsThePCRproductsofl4000gcncswcrcspottedontoachcmical-matcrial-coatcd-glassplatesinarray.DNAswerefixedontotheglassplateafterseriesoftreatments.Th
6、etotalRNAswereisolatedfrom4specimensofthepancreaticcancerandthenormaltumor-surroundingpancreatictissues.BothequalquantityRNAswerereverselytranscribedtocDNAsandlabeledwiththefluorescentCy5-dCTPandCy3-dCTPtopreparethehybridizationprobes.ThemixedprobeswerehybridizedtothecDNAm
7、icroarray.Aftcrhigh-stringcntwashing,thcfluorescentsignalswcrcscannedbyScanArray4000scanner.ThevaluesofCy5-dCTPandCy3-dCTPoneachspotwereanalyzedandcalculatedbyGenePixPro3.0software.ResultsByapplyingthiscDNAmicroarrayJ89differentiallyexpressedgenesinpancreaticcancer,whosera
8、tiosofCy5/Cy3werehigherthan20orlowerthan0.5,werescreenedoutamongthe14000targetgenes,compr
