化学热力学与生命科学

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1、化学热力学与生命科学作者:刘毅敏赵先英王祥智赵华文杨旭【关键词】熵;,,自由能;,,生命科学  摘要:综述了热力学中熵和自由能这两个重要状态函数在生命现象、肿瘤形成、抗癌药物研究、生物大分子结构研究、药物设计、蛋白质工程和基因优化表达等中的应用。  关键词:熵;自由能;生命科学  热力学是研究各种形式的能量转换规律的科学。热力学的基础是热力学第一定律和热力学第二定律,这两个定律都是人类长期实践和大量科学研究经验的总结。因为热力学研究的能量转换规律是自然界的一个基本规律,在其应用范围内具有指导意义。化学热力学是热力学原理在化学中的应用,它主要研究和解决化学变

2、化过程中能量转化的规律、化学反应的方向和限度。人体是一个巨大的化学反应库,生命过程是建立在化学反应基础之上的一个非常复杂的体系。近半个世纪以来,生物学研究从整体开始,自上而下进入分子层次,而化学研究则自下而上地逐渐接触生物体,化学与生命科学在细胞以下、分子以上的区域相遇,在这个区域不断生长出了许多新的生长点,成为生命科学和化学的前沿领域。基于热力学原理的生命科学研究也是一个新生长点,本研究就此综述如下。  1熵与生命科学  11熵与生命在化学热力学中熵(S)是一个重要的函数。熵是系统混乱度的量度,系统的混乱度越大,熵值越大。熵是状态函数,熵变(ΔS)只取决

3、于体系的始态与终态,与过程无关。在孤立系统的任何自发过程中,系统的熵总是增加的,这是热力学第二定律的一种表达,也称为熵增加原理。从宏观来看生命过程是一个熵增的过程,始态是生命的产生,终态是生命的结束,这个过程是一个自发的、单向的不可逆过程。衰老是生命系统的熵的一种长期的缓慢的增加,也就是说随着生命的衰老,生命系统的混乱度增大,当熵值达极大值时即死亡,这是一个不可抗拒的自然规律。但是,一个无序的世界是不可能产生生命的,有生命的世界必然是有序的。生物进化是由单细胞向多细胞、从简单到复杂、从低级向高级进化,也就是说向着更为有序、更为精确的方向进化,这是一个熵减的

4、方向,与孤立系统向熵增大的方向恰好相反。但是生命体是“耗散结构”,耗散结构认为一个远离平衡态的开放体系,通过与外界交换物质和能量,在一定条件下,可能从原来的无序状态转变为一种在时间、空间或功能上有序的状态,这个新的有序结构是靠不断耗散物质和能量来维持的。生命体通过不断与外界交换物质、能量、信息和负熵,可使生命系统的总熵值减小,从而有序度不断提高,生命体系才得以动态地发展。  12熵与肿瘤熵增加原理也可以解释肿瘤在人体内的发生、扩散。细胞基因癌变,造成人体正常基因组的异常活化,细胞无节制地扩增,使有序向无序转化,加速生命的耗散,熵值异常增大,在短期内熵值就增

5、到极大值,人的生命便终止了。现代医学研究表明,癌基因以原癌基因的形式存在于正常生物基因组内,没被激活时,不会形成肿瘤。原癌基因是一个活化能位点,在外界环境的诱导下,细胞可能发生癌变,即肿瘤的形成是非自发的。非自发的过程是一个熵减的过程,也就是说肿瘤细胞的熵小于正常细胞的熵[1]。然而肿瘤细胞是在体内发生物质、能量交换的,人体这个体系就相当于肿瘤细胞的外部环境,正是由于肿瘤细胞的熵减小,导致了人体这个总体系熵增大。越恶性的肿瘤,熵值越小,与体系分化越明显,使人体的熵增也相对越大,对生命的威胁越大。  13熵与抗癌药物的研究熵增原理对人们研究抗癌药物也有启发。

6、例如利用体细胞杂交法可获得分泌抗体的杂交细胞系,当导入的抗体素抑制癌细胞的恶变、削弱它的增殖时,细胞本身的混乱程度将会减小,趋向于稳定的低熵状态,这就相当于给体系内部输送了负熵,使体系趋于有序状态。又如DNA是许多抗肿瘤药物的靶分子,这些药物通过嵌入、沟槽等方式与癌细胞的DNA结合,抑制肿瘤细胞的分裂增生,最终使肿瘤细胞增生停滞,或使其向正常细胞分化,或诱导肿瘤细胞发生程序性死亡,从而产生抗癌作用。阿霉素(ADM)这个抗肿瘤抗生素就是以典型的嵌入方式与DNA相互结合的[2],破坏DNA的模块功能,阻止转录过程,在抑制DNA、RNA蛋白质合成的同时,也改变癌

7、基因的结构或影响癌基因的表达。由于ADMDNA复合物比独立的DNA和ADM分子更有序,因此导致一定程度的熵减,有序度增加。  2自由能与生命科学  在化学热力学中,自由能是一个很重要的状态函数,它是在等温等压及不作非体积功条件下化学反应自发进行的判据。如果ΔG<0,反应正向自发进行;ΔG=0,反应达平衡状态,ΔG>0,正向反应不能自发进行,而逆向反应能自发进行。  21自由能与生物大分子结构研究  211一种基于自由能的RNA二级结构的预测RNA在生命活动中有着重要作用,RNA的功能与其结构密切相关,因此研究RNA结构对理解RNA功能、原核基因

8、工程和与RNA有关的生命现象有着重要意义。但RNA分子降解快、晶体

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