差异基因表达分析法在胃癌中的应用

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1、差异基因表达分析法在胃癌中的应用【摘要】  [目的]探讨用蛋白质芯片技术筛选胃腺癌患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的标志性蛋白。[方法]采用蛋白质生物芯片表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI)技术,运用SAX2(StrongAnionicExchanger)蛋白质芯片检测胃腺癌患者、胃炎患者和健康者血清,建立诊断模型,然后进行单盲模型验证。[结果]发现5910Da、5084Da和8691Da的三个蛋白质荷比峰(M/Z)在胃腺癌和健康组比较中具有显著性差异。5910Da、6440Da的两个蛋白质荷比峰(M/Z)在胃腺癌和胃炎

2、组中比较具有显著性差异。[结论]建立了胃腺癌的血清蛋白指纹质谱,为以后的胃癌蛋白质组学研究奠定了一定的基础,建立了以5910Da、5084Da、8691Da和6440Da四个蛋白质峰为模型区分胃腺癌与非胃腺癌的血清蛋白表达质谱诊断模型,为胃腺癌的临床诊断提供了一条崭新的途径和方法。【关键词】表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 生物标记 胃腺癌  ApplicationofSerumProteomicPatternsforDetectionofGastricAdenocarcinomaserumprotEinprofil

3、ingofastricadenocarcinomabysurface-enhancedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry(SELDI-TOF-MS)todiscoveringthediscriminaloryprotEIns.[Methods]Thediagnosismodelofpatientsa,gastricismandhealthypersons,andtestedbysingle-blindmodel.[Results]Threespecificp

4、roteinfingerprintbiomarkersmassedat5910,5084,8691betagroupandcontrolgrouparkersmassedat5910,6440betagroupandgastricismgroupaproteinfingerprintandafoundationforlaterstudyofgastriccancerproteomicsisdeveloped.Thediagnosticmodeloftheproteinprofiling(5910Da,5084Da,8691Da,6

5、440Da)fordistinguishinggastricadenocarcinomafromnon-gastricadenocarcinomaisestablishedtoaidanea.2.InstituteofCellBiology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310031,China)Abstract:[Purpose]Toscreenout胃腺癌是常见的癌肿之一,占全部恶性肿瘤的第三位,占消化道恶性肿瘤之首,而且近年来发病有明显年轻化趋势。相当多的胃腺癌患者发现时已经是晚期,我国每年死于胃腺癌

6、约16万人。目前已有的肿瘤标志物单项指标检测胃腺癌的灵敏度仅为18%~40%,联合应用的结果虽然可达60%~80%,但假阳性率较高,难以用于早期诊断。因此,寻求早期诊断胃腺癌的特异方法是目前临床亟待解决的难题。我们利用表面加强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface?鄄enhancedlaserdesorptionandionisation,SELDI)技术,对胃腺癌患者与正常人和胃炎患者血清中的蛋白质进行对比分析,筛选可用于临床胃腺癌早期诊断的特异性生物标记物。1材料与方法1.1血清样品所有病人血清样品均为2003年8月~20

7、04年6月台州市立医院手术后病理检查确诊为胃腺癌患者的术前抽检标本,对照样品来自经健康查体正常的健康志愿者及经病理检查为活动性胃炎患者的血清。全血采集在10ml血清分离管中,4000r/min离心10min。取30μl血清分装在0.5ml离心管中,于-80℃冰箱保存。33例胃腺癌,其中男性22例,女性11例,平均年龄56.5岁(45~71岁);31例健康志愿者其中男性20例,女性11例,平均年龄63岁(43~70岁),30例胃炎患者其中男性20例,女性10例,平均年龄58.9岁(46~70岁)。另盲法试验组36例(15例胃腺癌、1

8、0例健康志愿者、11例胃炎患者)。1.2仪器和试剂美国赛弗吉公司(CiphergenBiosystems,Inc.)生产的表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SurfaceEnhancedLaserDesorptionIonization?鄄ti

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