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《川陕哲罗鲑cytb基因克隆及其在鲑亚科中的系统发育关系》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、四川动物2009年第28卷第6期SichuanJournalofZoologyVol28No62009川陕哲罗鲑Cytb基因克隆及其在鲑亚科中的系统发育关系祁得林1,晁燕1,杨成2,申志新2,唐文家2(1.青海大学农牧学院动物科学系,西宁810016;2.青海省渔业环境监测站)摘要:采用聚合酶链式反应克隆川陕哲罗鲑Huchobleekeri线粒体细胞色素b基因(Cytb),首次报道该基因的全长序列(1140bp,GenBank登录号FJ597623),并与鲑亚科中其他5属14个物种的Cytb基因进行同源性比较,
2、分析了碱基组成和变异情况,以白鲑亚科的白鲑Coregonuslavaretus作为外群构建了ML、NJ和MP系统发育树。遗传距离和分子系统学分析表明,川陕哲罗鲑与细鳞鲑属的细鳞鱼Brachymystaxlenok之间的遗传距离相对较小(8.47%),在系统发育树上两者聚在一起,提示川陕哲罗鲑与细鳞鱼存在较近的亲缘关系,该结果与以往的形态学分类不相符。关键词:川陕哲罗鲑;线粒体细胞色素b基因;克隆;系统发育分析中图分类号:Q959.4;Q7文献标识码:A文章编号:1000-7083(2009)06-0805-05
3、CloningofMitochondrialCytochromebGeneofHuchobleekerianditsPhylogeneticRelationshipsinSubfamilySamloninaeQIDelin1,CHAOYan1,YANGCheng2,SHENZhixin2,TANGWenjia2(1.AnimalScienceDepartmentofAgricultureandAnmialHusbandryCollege,QinghaiUniversity,Xining810016,China;
4、2.FisheryEnvironmentalMonitoringStationofQinghaiProvince)Abstract:Inthepresentstudy,thecompletesequenceofthemitochondrialcytochromebgenefromHuchobleekeriwasamplifiedandsequenced.ADNAfragmentof1140bp(GenBankaccessionno.FJ597623)wasreportedforthefirsttmie.Byco
5、mparingwiththesequencesfromfourteenotherspeciesrepresentingfivegenerainsubfamilySamloninae,thebasecompositionsanddivergencesamongthesesequenceswereanalyzed.Thealignedsequencesweresubjectedtomaxmiumlikelihood(ML),neighborjoining(NJ)andmaxmiumparsmiony(MP)anal
6、yseswhileusingCoregonuslavaretusasanoutgroup.MolecularphylogeneticanalysesshowedthatHuchobleekeriandBrachymystaxlenokclustertogetherandtherewasrelativelylow(8.47%)geneticdistancebewteenthem,suggestingthatthereisarelativelyclosedrelationshipbetweenHuchobleeke
7、riandBrachymystaxlenok.Theresultwasnotconsistentwithprevioustaxonomicstudiesbasedonmorphologicalcharacteristics.Keywords:Huchobleekeri;mitochondrialcytochromebgene;clone;phylogeneticanalyses川陕哲罗鲑Huchobleekeri隶属于鲑形目Samlo减,分布水域不断萎缩和片断化,1988年被国务院niformes,鲑科Salm
8、onidae,鲑亚科Samloninae,哲罗列为级保护动物,1998年中国濒危动物红皮书鲑属Hucho,是长江上游特有的珍稀鱼类,也是我国鱼类将其列为濒危物种(乐佩琦,陈宜瑜,仅有的3种哲罗鲑属鱼类之一,主要分布在北纬291998),2004年中国物种红色名录(第一卷)将其~33的秦岭以南的长江流域北侧的岷江水系和汉列为濒危物种(汪松,解焱,2004)。江水系,是哲罗鲑属鱼类分布纬度
