高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化(李金明).pdf

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1、高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化李金明国家卫生计生委临床检验中心全国cfDNA检测标准化高峰论坛2016.11.23-24长沙基因测序技术的发展1953年：DNA双股螺旋的发现（英国剑桥大学JamesWatson和FrancisCrick）1965年：酵母tRNA测序（美国Comell大学RoberHolley，小片段重叠法）1971年：λ噬菌体两个粘性末端的完整序列（吴瑞博士，华裔分子生物学专家，引物延伸测序）1975年：加减法DNA测序（英国剑桥大学Fred）1977年：Sanger测序（英国剑桥大学FredSanger）和Maxam-GillbertDNA化学降解法测

2、序(美国哈佛AlanMaxam&WalterGilbert）1996年：焦磷酸测序（瑞典皇家技术研究所RonaghiM等）2005年:GenomeSequencer20新一代测序仪(大规模并行焦磷酸合成测序法，454lifeScience公司的创始人JonathanRothberg)2007年:454、Solexa公司和Agencourt（SoliD测序仪）公司分别被Roche、illumina和ABI公司收购。新一代测序技术（next-generationsequencing）2007年被NatureMethods评为生物领域影响力最大的技术精准医学不等于高通量测序高通量测序是目前精

3、准医学实践最为成熟的支撑技术高通量测序技术的临床应用染色体非整倍体无创产前筛查（NIPT）胚胎植入前遗传学筛查（PreimplantationGeneticScreening，PGS）和胚胎植入前基因诊断（PreimplantationGeneticDignosis，PGD）肿瘤靶向治疗基因突变检测单基因遗传病检测病原微生物检测：如HPV基因分型、宏基因组（Metagenomics）测序┈┈高通量测序技术临床应用的质量管理与标准化国家卫生计生委医政医管局高通量测序临床应用试点实验室：评审标准、评审、试点实验室基本要求、管理试点实验室2015年增加质评调查：全国肿瘤诊断与治疗高

4、通量测序检测2016年新增质评计划：染色体非整倍体（21、13、18）无创产筛2016年质评调查：肿瘤游离DNA（ctDNA）检测2017年正式开展：全国肿瘤基因突变高通量测序（组织样本）检测质评计划批准的第一批四个专业的试点单位全面质量管理？写你所应做的做你所写的记录你已做的分析你已做的以ISO的标准如ISO15189为标志的！标准化？标准化是对实际与潜在的问题作出统一规定，供共同和反复使用，以在预定的领域内获取最佳秩序和效益的活动。标准化＋全面质量管理！病原体核酸标准物质的单位IU（InternationalUnit）/mL有关标准品单位和溯源的问题长度单位的确定和溯

5、源举例火箭助推器宽度和铁轨间距（4.85英尺)的溯源牵引一辆战车的两匹马的屁股的总宽度罗马战车的宽度英国马路辙迹的宽度是4.85英尺马车轮距的标准英国电车轮轨间距的标准现代铁路铁轨间距4.85英尺铁轨的宽度决定了铁路上隧道的宽度美国航天飞机的火箭助推器的宽度“英尺”的由来？Foot最初是一个成人的脚长？德国人异议：因人而异16个男子左脚长度的均值质量管理与实验室医学标准化？（laboratorymedicine）实验室医学的时代！70%或90%以上信息来自实没有精准验室检测何来精准医疗？个体化医学（personalizedmedicine)精准医学（precision预测诊断监测预后me

6、dicine）移动医疗数字医疗精准医学计划（PrecisionMedicineInitiative）新生儿测序计划（BabySeqProject）标准化的关键点检验申请单是合适的：对“Who”在“When”开出“What”申请单标本是正确的和好的：采集、运送和保存实验室环境条件是好的：温湿度、可能的干扰的涉及临床医生检测申请单、标本采集环节避免（分区、灰尘、电磁、振动等）标本采集、和实验室运送和保存（分析前）仪器设备状态是好的：维护、定期校准试剂是好的：性能验证或性能确认、批质检结果报告解室内质控释及临床应质量保证（分析中）用（分析后）实验室人员是有能力的：外部和内部培训，能力评

7、估涉及实验室涉及实验室人员和临床医生SOP的可操作性及全员遵循室间质评（分析中）得到结果的过程是有监控的：室内质量控制和室间质量评价（或实验室间比对）涉及实验室针对差错、投诉、失控等分析原因采取措施的质量持续改进临床医生能正确的理解和应用检验结果于患者疾病的诊断和治疗国家卫生计生委高通量测序试点实验室要求基本要求（1）1.试点实验室应在国家卫生计生委批准的试点专业范围内开展临床检测工作。2.试点实