结核分支杆菌耐药基因的杂交检测

《结核分支杆菌耐药基因的杂交检测》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。

1、结核分支杆菌耐药基因的杂交检测【摘要】目的采用PCR-反向斑点杂交检测结核分支杆菌中rpoB基因、KatG基因和rpsL基因突变。评价该方法检测结核分支杆菌利福平(RFP)、异烟肼(INH)和链霉素耐药性，探讨直接检测结核患者痰标本的可行性。方法用PCR-反向斑点杂交技术分析对75株临床分离株和45例肺结核患者涂阳痰标本进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测。结果临床耐药株分离株进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测，其突变率分别为83．9％、62．5％、57．1％。肺结核患者涂阳痰标本中耐药株突变率分别为81．0％、60．0％、52．9％。结论rpoB

2、基因、KatG基因和rpsL基因突变与结核分支杆菌耐利福平、异烟肼和链霉素密切相关，应用PCR-反向斑点杂交技术可快速检测结核分支杆菌对异烟肼、链霉素和利福平耐药性。PCR-反向斑点杂交技术有望成为结核分支杆菌耐药性检测的重要方法之一。　　【关键词】结核分支杆菌；反向斑点杂交；药物耐受性　　　　近年来全球结核病呈现死灰复燃的趋势，其主要原因是耐药(DR-TB)和耐多药(MDR-TB)结核病的广泛分布和迅速传播。异烟肼(INH)、链霉素(SM)、利福平（RFP）作为结核病治疗中最主要的一线抗结核药物，对其耐药性的研究日益受到重视。传统的结核分支杆菌耐药性测定由于需要6～

3、8周时间，不能及时指导临床用药。近年来，随着分子生物学技术的不断发展，对结核菌的耐药机制有了进一步认识，认为结核分支杆菌耐异烟肼的产生是过氧化氢酶－过氧化物酶的编码基因KatG基因的缺失和突变有关，也inhA基因突变也有相关性；耐链霉素的产生是由于其核糖体蛋白S12编码基因rpsL和16SrRNA的编码基因rrs的缺失和突变所导致；结核分支杆菌耐RFP与其核心区域rpoB基因突变有关[1、2]。笔者采用采用PCR－反向斑点杂交技术分别对肺结核患者痰标本临床分离株和结核患者痰标本直接进行KatG基因、rpsL基因、rpoB基因的突变检测，现将结果报告如下。　　1资料与方

4、法　　1．1标本来源75株临床分离株和45例肺结核患者涂阳痰标本均来自吉林市结核病防治研究所，其中31例耐RFP，28例耐INH，24例耐SM。45例肺结核患者涂阳痰标本按结核病诊断细菌学规程进行菌种鉴定及药敏实验证实为结核分支杆菌，其中21例耐RFP，17例耐INH，20例耐SM。　　1．2细菌DNA的制备[3]临床分离株DNA用常规酚／氯仿抽提法提取标本中DNA。　　1．3PCR扩增采用25ul反应体系，4×dNTPs终浓度为0．2mmol／L，Bio-标记引物终浓度为0．2umol／L，扩增程序为：94℃变性Imin，58℃退火1min，72℃延伸Imin，

5、循环30次，最后72℃延伸10min。扩增产物经2%琼脂糖凝胶电泳。紫外检测出现267bp条带。　　1．4杂交检测将点有探针的硝酸纤维素膜装入杂交袋中，加入杂交液放置水浴锅中进行预杂交：45℃×30min。将Bio-标记引物的PCR扩增阳性产物变性：95℃×l0min，取出迅速放入冰盒中，每ml杂交液一般加l0ul变性的扩增产物，放置水浴锅中进行杂交：45℃×30min。洗膜：洗液1、45℃×3min，洗液2、45℃×3min。SA-AP：用l：1000的稀释液(洗液I)与膜在37℃作用30min。洗膜：洗液I、45℃×3min，洗液II、45℃×3min。显色：每毫

6、升洗液I加入NBT6．6ul、BICP3．3ul混匀，将配好的显色液加入杂交袋中，闭光37℃显色5min，观察结果　　2结果　　应用PCR-反相斑点杂交技术检测rpoB、rpsL和KatG基因突变结果（见表1、2）。75株临床分离株进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测，PCR扩增均为阳性，其耐药株突变率分别为83．9％、62．5％、57．1％，其敏感株突变率分别为0、0、2．1％。　　45例肺结核患者涂阳痰标本进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测，其耐药株突变率分别为81．0％、60．0％、52．9％,其敏感株突变率分别为0、4．1%、3．7％。

7、　　　　3讨论　　目前，结核分支杆菌耐药性测定仍多采用绝对浓度法、比例法等经典方法。但由于结核分支杆菌生长缓慢，而耐药结核分支杆菌生长更为缓慢，其耐药性测定需6～8周甚至更长，不能及时指导临床用药。Bactec结核培养系统因其价格昂贵等诸多不便限制了其广泛使用。近年来，随着分子生物学的不断发展已研究发现结核分支杆菌耐RFP与其核心区域rpoB基因突变有关，结核分支杆菌耐异烟肼的产生是过氧化氢酶－过氧化物酶的编码基因KatG基因的缺失和突变有关，也inhA基因突变也有相关性；耐链霉素的产生是由于其核糖体蛋白S12编码基因rpsL和16S