学术干货共聚焦显微镜中荧光团的共定位

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1、学术干货：共聚焦显微镜中荧光团的共定位在多标荧光样品图像中，因两个或多个荧光团在显微结构中距离很近，经常会有发射信号叠加，这种效应就称为共定位。目前，高特异性合成荧光团和经典免疫荧光技术的应用、精密光切技术的应用、共聚焦和多光子显微镜提供的数字图像处理技术等大大提高了生物样品中共定位检测的能力。图1共定位在生物表述上是这样定义的：两个或多个不同的分子位于样品上同一个物理位置。对显微镜中看到的组织切片、单个细胞或亚细胞器官，共定位意味着不同的分子连接到同一个受体上；在数字图像方面，这个术语指的是不同荧光分子发射的颜色分享图像中的同一个像素。在共聚焦显微

2、镜中，样品被记录成含有很多像元的多维阵列数字图像，每个像元代表一个三维像素。像元的尺寸（或检测单元）由物镜的数值孔径、照明波长以及共焦检测针孔直径等决定。因此，在一个样品中两个荧光探针的共定位，比如发绿光的AlexaFluor488，发橘红色光的Cy3，在图像中就是由含有红色和绿色两者贡献的像素表示（经常产生各种各样的橘色和黄色）。举一个例子，图1的一系列图表明了骨骼肌动蛋白和黏着斑蛋白侧向光学平面上的共定位（激光扫描共聚焦显微镜中的XY面）。这些共定位点可作为肌动蛋白丝的成核位点，也可作为外部介质、质膜和肌动蛋白骨架之间的交联剂。图1（a）是Ale

3、xaFluor568通道（目标对象是黏着斑蛋白），由543nm的氦氖激光器激发；而Figure1（b）是AlexaFluor488通道(目标对象是丝状肌动蛋白)，由488nm的氩离子激光器激发；Figure1（c）是前面两幅图的叠加，表明两种荧光信号在丝状肌动蛋白纤维末端的共定位。必须指出的是，共定位并不指的是具有相似发射光谱的荧光团出现在合成图像的同一个像素上。准确的共定位分析只有在荧光团的荧光发射光谱足够分离且滤色片（或光谱狭缝宽度）正确设置的情况下才有可能。荧光团发射光谱之间的大量叠加或滤色片组合的不正确使用，都可能导致光谱串色，这种情况下共定

4、位的测量就没有意义。为了避免产生共定位假象，荧光团必须与照明光源的光谱认真匹配（共聚焦中是激光线），来获得最大激发效率，同时在发射光谱之间保持一定的分离度。在大多数情况下，对共定位分析来说，荧光团的选择对获得满意结果极为重要。在图2中，对AlexaFluor染料家族的光谱叠加作了比较，这在共定位实验中是很有用的。为了比较，所有的发射光谱都做了归一化，叠加区域用灰色阴影显示。在图2(a)中，绿色荧光染料AlexaFluor488和橙黄色荧光染料AlexaFluor555在峰波长处显示很明显的分离，人眼也很容易能够区分。然而，光谱叠加（灰色阴影区域）表明

5、在AlexaFluor555的发射峰上很明显有Alexa Fluor488的发射光谱（用一条黑线标示，从发射峰到横坐标）。当AlexaFluor 488的荧光发射强度明显比AlexaFluor555的荧光发射强时，荧光信号这么高程度的串色使得荧光探针的分离很难。很多因素都会导致这种情况发生，比如荧光团标的物浓度的巨大差异。因此，在共定位实验中，这些探针的组合就应该避免，或只有当图像在多通道共焦模式采集下才可以使用，这样可以降低或消除串色。图2AlexaFluor探针之间的光谱叠加程度会随着探针发射峰之间的距离增加而下降，如Figure2(b)所示。在

6、这种情况下，AlexaFluor488和深红色染料Alexa Fluor633与Figure2(a)比较，重叠区域明显降低。这两种染料人眼都很容易区分，光谱重叠程度低在共定位实验中可使串色最小化，如每个探针的浓度相似的话，应该可以产生较好的结果（注意：深红色的荧光染料AlexaFluor633在低浓度时通过显微镜目镜很难观察到）。AlexaFluor633可被红色氦氖激光器的633nm线最有效的激发，也可被黄色氦氖激光器的594nm激发。或许，在Alexa Fluor染料发射的可见光区域，最好的光谱分离是AlexaFluor488和AlexaFluo

7、r 647的结合（图中未显示）。实际上，在这些染料之间没有光谱重叠，即使样品含有过量的AlexaFluor488，应该也没有串色。具有这些特点的荧光探针是共聚焦显微镜分析共定位的理想选择。在共聚焦显微镜中，测定共定位的能力受限于光学系统的分辨率及用于照明样品的入射光波长。宽场荧光和共聚焦显微镜理论分辨率约为200nm，但在实际上，由于各种原因这个数降到400nm和600nm之间，原因包括显微镜光路未完全对准、光学折射率波动、光学像差及样品制备的不合适。然而，对于一个已经完全调好的共聚焦显微镜来说，两个荧光分子是否连接到同一个目标对象上，或者它们是否定

8、位在同一个器官上受光学分辨率影响。共定位的许多实验是围绕高特异性的合成探针和抗体进行的，标记目标是容易区分的