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时间:2018-10-28
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1、南■^复昔*屬专业文献综述题姓学专班学职称:目:名:院:业:级:号:教师:基因芯片技术在肠道菌群检测屮的运用摘要:在健康人体肠道内存在着许多的细菌,这些细菌能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,还能控制人体对癌症治疗药物的反应,对于人体健康非常必要。但是肠道菌群成分非常复杂,传统的生化鉴定方法并不能很好地用来分析肠道菌群。基因芯片技术是近年來兴起的一种新型检测方法,操作简单,灵敏度高,可以对肠道菌群进行很好的分析。本文介绍了基因芯片技术的原理、过程分类及其在肠道菌群检测中的应用。;词:基因芯片;原理;过程;肠道菌群Abstract:Therearemanyintesti
2、nalbacteriainthehealthyhuman,thebacteriacanaffectweightanddigestiveability,resistinfectionandriskofautoimmunedisease,.theycanalsocontrolthebody'sresponsetocancertreatmentdrug.Sotheyarenecessaryforhumanbodyhealth.Buttheintestinalfloracompositionisverycomplicated,thetraditionalbiochemicalidentifica
3、tionmethodcannotanalysisintestinalflorawell.Genechiptechnologyisanewtypeofdetectionmethodrisinginrecentyears,whichiseasytooperateandhavehighsensitivity.Soitcanbeagoodanalysiscarriedoutontheintestinalflora.Thispaperintroducestheprinciple,process,classificationofgenechiptechnologyanditsapplicationi
4、ndetectionofbacteriaintheintestine.Keywords:Genechip;Theprinciple;Process;Intestinalflora一、基因芯片技术1.简介基因芯片技术是近年来发展起来的一项分子生物学技术,基因芯片是指在平而载体(如硅片、玻璃片、尼龙膜等)和载体上按照某种预先设计的位置高密度有序排列的成千上万核酸探针(如DNA,寡核苷酸或基因片段),也称DNA芯片或DNA微阵列。基因芯片技术融合了生命科学、化学、微电子学、计算机科学、统计学和生物信息学等诸多学科领域的成就,具有高通量、高集成、微型化、平行化、多样化和自动化等特点,为细菌、病毒
5、、真菌等病原体的种类鉴定、功能基因及耐药性检测等提供了一个强有力的工具。2.原理基因芯片技术的本质是分子杂交,根据碱基互补配对原则,用己知序列的探针对未知序列的核苷酸序列进行杂交。但与传统分子杂交技术不同的是,它通过像集成电路制作过程中半导体光刻加工那样的微缩技术,将现在生命科学研宂中许多不连续的、离散的分析过程,如样品制备、化学反应和定性、定量检测等手段集成于1cm〜2cm大小的基片(硅片、玻璃和尼龙膜等),在上面固定核酸、蛋白及多肽序列等大量探针分子,形成高密度点阵,与样品中的靶分子作用后,通过分子杂交技术在相同条件下进行反应,反应结果用同位素法、化学荧光法、化学发光法或酶标法显示,
6、然后用精密的扫描仪或激光共轭聚焦(CCD)摄像技术记录,由计算机进行分析、综合,并使这些分析过程连续化和微型化[1]。3过程基因芯片技术主要分为4个步骤进行,即芯片制备、样品制备、杂交反应、信号检测和结果分析,操作简单、快捷、特异性强、敏感性高[2]。(1)芯片制备主要是原位合成法和直接点样法。原位合成法适用于寡核苷酸;点样法多用于大片段,有吋也用于寡核苷酸。原位合成法是在玻璃等硬质表面上直接合成寡核苷酸探微流体通道合成法针阵列,是目前制造高密度寡核苷酸芯片最为成功的方法,S前主要有原位光控合成法(主要包括光脱保护合成技术和光敏抗蚀层并行合成技术等)、原位喷印合成法、微流体通道合成法及分
7、子印章多次压印DNA阵列合成法等,其关键是高空间分辨率的模板定位技术和高合成产率的DNA化学合成技术,适合制作大规模DNA探针芯片,实现高密度芯片的标准化和规模化生产。其优点是反应量大,探针的密度高并且可以和其他芯片制备方法结合使用,该方法的缺点是探针的长度较短,一般为20〜50bp。点样法比原位合成法简单,是利用多个微细加样针的点样仪将预先制备好的寡核苷酸或DNA探针快速、准确地定量点样于芯片表面。点样法包括接触式点样和非接触式点
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