如何查找一个基因的启动子序列

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1、定义：启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA序列。包含核心启动子区域和调控区域。核心启动子区域产生基础水平的转录，调控区域能够对不同的环境条件作出应答，对基因的表达水平做出相应的调节。一般查阅外文文献，老外从转录起始位点（TranscriptionStrartSite，TSS，记为＋1位）开始上溯2K－3K的区间算做是启动子区域：启动子的范围非常大，可以包含转录起始位点上游2000bp，有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结合位点，因此也属于启动子范围。8票票数DoOneThing,AndDoItWell

2、.mybbffeditedon2005-07-2208:41举报·超级细菌耐药性基因多重PCR检测·【原创】ensembl改版后如何查找启动子·【原创】使用UCSC查找一个基因的启动子序列（终）·【共享】如何查找基因启动子，外显子，内含子序列-最新的资料Revelation2005-05-0711:23消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·34积分·12得票·246丁当加关注·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网下面以BCL-2基因为例，查找查找该基因的启动子区域，首先要找到该基因的基因组序列。去NCB

3、I吧，在Search的下拉菜单里找到Gene，在检索项里输入Bcl-2，检索第一项就是bcl-2forhuman，点进去看看啥样。。。0票票数DoOneThing,AndDoItWell.举报·•【消息】ACEI+ARB，你给血透患者用这样的组合吗？Revelation·34积分·12得票·246丁当加关注2005-05-0711:29消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网首先你可以看到该基因的参考序列（referencesequence）,然后看到bcl-2的位置和

4、基因组背景。bcl-2上游是PHLPP，下游是FVT1基因。在这个长长的网页的最后是已经注册的Bcl-2基因的信息。0票票数DoOneThing,AndDoItWell.Revelationeditedon2005-05-0711:59举报·基因过表达Revelation·34积分·12得票·246丁当加关注2005-05-0711:35消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网看到基因组序列了么，点进去，根据序列信息自己就能定位转录起始位点，上游就是promoter了，

5、简单吧。不！我觉得麻烦。有更简单的方法么？有！注意到在网页的开头有这么个链接么？HGNC：9900票票数DoOneThing,AndDoItWell.举报·•【消息】ACEI+ARB，你给血透患者用这样的组合吗？Revelation·34积分·122005-05-0711:38消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网得票·246丁当加关注点进去，看看吧。原来是BCL-2的symbolreport，各种各样的连接。注意到左下角的EnsemblGeneView了么，很有用的

6、，点击。0票票数DoOneThing,AndDoItWell.举报·jetPEIDNAtransfectionreagentRevelation2005-05-0711:42消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·34积分·12得票·246丁当加关注·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网呵呵，原来到了Ensemble了，是Ensemble的report。列出了一堆令人兴奋的信息，太全了，只要是和这个基因相关的信息都能找到，包括SNP，Isoforms，等等等。我们感兴趣的是，这个连接“Viewgenomi

7、csequenceforthisgenewithexonshighlighted”0票票数DoOneThing,AndDoItWell.举报·•【读片】产科疑难超声病例（299）：十指连心，水深请谨慎Revelation·34积分·12得票·246丁当加关注2005-05-0711:48消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·人人网点击，看看，原来是bcl-2的基因组结构，红底色碱基是exon，绿底色碱基是SNP，太牛了。别光高兴，忘了找promoter，默认的这个repor

8、t只是显示bcl-2，上游600bp，下游600bp。想想，短了一点。怎么样让5'端多显示几百个碱基呢？秘密在这里。。。0票票数DoOneThing,AndDoItWell.举报·罗氏NimbleGen比较基因组杂交4x72K芯片服务Revelation·34积分2005-05-0711:55消息引用收藏分享分享到哪里？·复制网址·新浪微博·豆瓣社区·腾讯微博·开心网·1