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时间:2018-10-12
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1、API鉴定系统在食品微生物学检验中的应用宋嵩文(广丙玉林食品药品检验所广丙玉林537000)【摘要】目的提高对API鉴定系统的认识及应用。方法了解API鉴定系统的基木原理,掌握实际应用的操作要点。结果API鉴定系统提高了致病菌的检出水平和准确性,简化操作程序,对日常的检验工作具有很现实的指导意义,值得推广。【关键词】API鉴定系统微生物检验细菌分型技术【中图分类号】R155.5【文献标识码】A【文章编号】2095-1752(2012)16-0084-03API是AnalyticProductsINC的简称。AF
2、>I鉴定系统是由法国生物一梅里埃公司生产的细菌数值分类分析鉴定系统。该系统品种齐全,括的范围广,鉴定的能力强,数据库在不断地完善和补充,目前约有1000种生化反应,可鉴定的细菌大于550种。是世界范围内应用最广、种类最多、最受微生物学家推崇的国际标准化产品。被许多国家和组织列入标准方法中[1]。目前在我国各级疾病预防控制机构、食品、药品、化妆品和临床微生物检验中也比较多地应用此项技术,但在实际应用中由于对基木原理及产品性能的不了解,在使用中经常出现一些问题。木文拟就API鉴定系统的原理、使用中的一些常见问题作一
3、介绍。1API鉴定系统的原理[2]1.1数据库API系统用于细菌鉴定的品种有15种,分别有相应的数据库。数据库由细菌条目(taxa)组成,每个条目可能因情况的不同代表细菌种、细菌的生物型、细菌的菌属。鉴定主要依据API试剂条的生化反应结果将一种/组细菌与其它细菌相鉴别,并用%id(鉴定百分率)表示每种细菌的可能性。1.2数值鉴定的基木原理数值鉴定是通过出现频率的计算来进行的,即每个细菌条目对API系统中每个生化反应出现频率总和的比较。1.2.1出现频率的计算,将记录成阳性或阴性的结果转换岀现频率。1.2.1.1
4、若为阳性,用100除。1.2.1.2若为阴性,先用100除,再用1减去此商数。1.2.1.3若百分率是0或100,则频率用近似值0.01或0.99代替。1.2.2在每一个细菌条0中,将所奋测定项0的出现频率相乘,得出每一个细菌条目的总出现频率,每个分类菌群中的所奋菌的总出现频率相加为多项总发生频率。1.2.3每一个细菌条0的总出现频率被多项总发生频率相除后,乘以100得到单项鉴定百分率,即%1么全体鉴定百分率之和应等于100。1.2.4在每个菌群中,再按%id值的大小顺序重新排列。1.3编码一从生化反应谱到数码
5、谱各类API试剂条均由多个生化反应组成,编码即是将生化反应谱转换成数码谱,以便于使用生化反应检索手册或API电脑分析软件进行检索,确定生化反应谱对应的是什么细菌。编码的原则是将所有的项0,每3个分为一组,每组按其位置,第1位阳性吋标记为1,第2位阳性吋标记为2,第3位阳性吋标记为4,所有阴性反应均标记为0,再将每组标记的数字相加成•-个数字,结果可能是0〜7中的任一数字。这样可将鉴定条的生化反应谱编码成-组7〜10位的数码谱。以API20E为例,鉴定条总共奋20个生化反应,附加氧化酶实验组成21个实验,编成7组
6、。如某一未知菌通过编码得出的数码谱为5144512,使用API20E生化反应检索手册或API电脑分析软件进行检索,可确定该未知菌为大肠埃希氏菌。有些情况下,如一个编码下冇几个菌名的,7位数字尚不足以分辨,还需要做-些补充实验,补充实验的项B根据具体情况而定。如硝酸盐还原成亚硝酸盐(NO)、硝酸盐还原成氮(Nz)、动力(MOB)、麦康凯琼脂上生长(McC)、葡萄糖氧化(OF-0)、葡萄糖发酵(OF—F)等。1.4查码一从数码谱到细菌名称查码就是使用生化反应检索手册或API电脑分析软件进行检索,以确定未知菌为何种细
7、菌的过程。下面是检索手册或软件中冇关内容的解释。1.4.1一个编码中只奋一个菌名吋,很容易确定是何种细菌。1.4.2如有几个菌名吋,则按以下方法判断。1.4.2.1第1个菌名的%id≥80.0吋,未知菌被鉴定在该条0中,结合%1(1值的大小及T值对鉴定的可信度做出评价如下:%id≥99.9T≥0.75为极好的鉴定99.8≤%id≤99.0T≥0.75为很好的鉴定90.9≤%id≤98.9T≥0.25为好的鉴定80.0≤%id≤89.9T≥O
8、为可接受的鉴定%id<80为低分辨率1.4.2.2如果第1个菌名的°/^&七80,可将前两个菌的%!€)加在一起。如还不足80,可将前3个菌的%id加在•一起,如前3个菌的%id加在一起仍<80,则该结果是“不可接受的”。如其和超过80,则有两种可能:一种情况是“鉴定到种水平”,这必须是这几个加在一起的条0是同一个细菌“种”内的不同生物型;另一种情况是“鉴定到属水平”,这必
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