rho激酶抑制剂三维定量构效关系研究

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1、上海应用技术学院毕业设计(论文)题目：Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究专业：应用化学班级：XXXXXXX学生姓名：XXX学生学号：XXXXXX指导教师：XXXX化学与环境工程学院2013年6月3日上海应用技术学院毕业设计（论文）任务书 题目：Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究学生姓名：XX学号：XXXXXXX专业：应用化学任务起至日期：  2013     年   1 月    1 日至      2013 年   6 月  18  日 共  18   周一、课题的任务内容：本论文将采用3D-QSA

2、R法，在SYBYL-X2.0的水平下，以部分分子结构和生物活性（pIC50值）已知的Rho激酶抑制剂分子为训练集,选用此系列分子的理化描述子,包括分子的形状,静电作用能和范德华作用能以及疏水描述子,用三维定量构效关系(3D-QSAR)方法建立反映分子结构与生物活性之间的定量构效关系模型。并基于此模型来设计新的Rho激酶抑制剂分子和进行结构修饰。二、原始条件及数据： 原始资料来自于文献和指导教师提供的资料三、设计的技术要求（论文的研究要求）： 建立具有显著统计学意义，预测能力良好的3D-QSAR模型四、毕业设计

3、（论文）应完成的具体工作： 1．分子结构的搭建2．分子叠合3.COMFA、COMSIA回归分析（3D-QSAR模型的建立）4.COMFA、COMSIA模型结果分析5.新型活性分子设计及活性预测 软硬件名称、内容及主要的技术指标（可按以下类型选择）：计算机软件SYBYL-X2.0  结构模型 √ 五、查阅文献要求及主要的参考文献：           要求：查阅中文文献10篇，外文文献5篇以上主要参考文献：1.RamasamyThilagavathi,RajKumar,VemaAparna,M.Elizabet

4、hSobhia,BulusuGopalakrishnanandAsitK.Chakraborti.“Three-dimensionalquantitativestructure(3-DQSAR)activityrelationshipstudiesonimidazolylandN-pyrrolylheptenoatesas3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoAreductase(HMGR)inhibitorsbycomparativemolecularsimilarityindicesa

5、nalysis(CoMSIA)”Bioorganic&MedicinalChemistryLetters,2005,15:1027–10322.AssiaKovatcheva,GerhardBuchbaueretal.QSARModelingofr-CampholenicDerivativeswithSandalwoodOdorJ.Chem.Inf.Comput.Sci.2003,43,259-266 六、进度安排：（设计或论文各阶段的要求，时间安排）：求计算机应用能力和英语阅读能力较强工作计划：要求完成下列

6、内容：1．分子结构的搭建；2．分子结构的优化；3．分子的叠合；4．3D-QSAR模型的建立；5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。工作计划：第1周—第3周查阅文献和收集资料。第4周—第13周分子结构的搭建、优化、模型的建立与验证第14周—第15周新型活性分子设计及结构修饰第16周—第18周撰写论文，准备答辩。 指导教师：XXX                    审核意见：  教研室主任： Rho激酶抑制剂三维定量构效关系的研究摘要：运用比较分子力场分析方法（CoMFA）和比较分子相似性指数分析

7、法（CoMSIA）对一系列Rho激酶抑制剂化合物的结构参数和pIC50值进行分析，以58个分子结构和pIC50值已知的Rho激酶抑制剂化合物为训练集,用三维定量构效关系（3D-QSAR）方法建立了预测模型，采用抽一法(leaveoneout，LOO)检验了预测模型的可信性，接着用一个由5个Rho激酶抑制剂化合物组成的测试集进一步验证预测模型的预测能力，用交叉验证系数q2和相关系数R2的值来证实3D-QSAR预测模型是否有良好的预测能力。研究结果表明我们所建立的3D-QSAR模型在统计学上具有明确、良好的预测能

8、力。关键词：三维定量构效关系（3D-QSAR）；Rho激酶抑制剂；pIC50值；CoMFA；CoMSIAStudyofthe3Dquantitativestructure-activityrelationship(QSAR)inRhokinaseinhibitorAbstract：Usingcomparativemolecularfieldanalysis(CoMFA)andcomparativem