世代方差遗传分析

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1、世代方差的遗传分析莫惠栋AGeneticAnalysisforGenerationVariances一、群体性质和方差分量在遗传学上,根据等位基因的是否相同,可把基因型分为两类:(1)纯合的(homozygous),即等位基因相同的,如;这种基因型的自交后裔不会分离,除非发生突变。(2)杂合的(heterozugous),即等位基因不同,如;这种基因型的有性后裔必发生分离,从而产生遗传方差,即由遗传因素而造成的变异。一个世代群体,可由单一或若干基因型组成。如果由单一基因型组成,则不论纯合或杂合,该

2、群体即为同质的(homogeneous);如果由若干不同基因型,则该群体称为异质的(heterogeneous)。根据以上定义,常见的植物育种群体可归类为:(1)同质纯合群体,如自交作物的品种;(2)同质杂合群体,如自交作物杂交的、无性繁殖系;(3)异质纯合群体,如自交作物杂交后代的高世代品系群和地方品种;(4)异质杂合群体,如自交作物杂交后代的分离世代、异交作物的品种。一个群体的表型方差分量,随该群体的同质或异质而异。(一)同质群体的方差分量同质群体的组成基因型不存在遗传差异,故一般而论,其变异

3、属于环境效应。因而同质群体中每一个体观察值的线性模型可给定为:(1)(1)中的为第个体的表型值,为群体平均数或遗传背景效应(geneticbackgroudeffect),为第个体的环境效应,为群体容量。由(1)可得群体的表型方差和环境方差为:即有:(2)所以,一个同质的世代群体,不论其基因型为纯合或杂合,其表型方差即环境方差;这种群体只能为我们提供一个群体平均数和一个环境方差。这里需要注意的是:和不一定纯由环境变异造成,常常还混杂着基因型在发育上的不稳定性(或谓对环境敏感)和基因型×环境互作而产

4、生的变异。只是为简化头绪,我们暂不考虑这些问题。(二)异质群体的方差分量异质群体除环境效应外,还有因组成基因型不同而产生的遗传效应。设一群体的某一性状有种基因型,每一基因型有个个体,则个体观察值得线性模型为:(3)(3)中的和分别为第个体的表型值和环境效应;为第基因型的遗传效应(为第基因型群体平均数),同(1)。由(3)可得表型方差、遗传方差和环境方差分别为:因而有:(4)(4)说明,异质群体的表型方差可分解为和两个分量。如果遗传(基因型)效应可以再分解(这与交配设计有关),则亦可作相应得分解。例

5、如,在加性-显性模型下,可再分解为加性效应和显性效应,即,则就可再分解为加性方差和显性方差,即。在育种实践中,的估计是极其重要的。一个育种群体的选择潜力,与(对自交作物是)成比例;只有当存在且足够大(与相比较)时,才能对选择压力产生响应。若或(群体趋于同质),选择即不再有效。二、自交作物世代群体的方差分量以下以自交作物的世代群体为例,讨论在加性-显性模型下的群体方差和分量。(一)亲本和群体自交作物的亲本和群体都是同质的,故根据(2)有:即、和群体的表型方差都是环境方差。当由样本均方、和估计时,即有

6、。在各群体的样本容量相似时,一般可用算术平均数估计,即或(5)或(6)(6)一般用于异交作物的自交系间杂种品种。因自交系对环境反应敏感,缺少生物学代表性,故由代估计之。(二)群体由于代杂合,其基因分离使代成为异质群体,故的表型方差可根据(4)而完成:。在表1以1对等位基因的分离为例,可导得加性-显性模型下的为:当推广于对独立等位基因时则有:表1F2群体的遗传变异基因型型值频率总和1这里的和,即世代遗传方差中的加性方差和显性方差,可分别记为和。对于,由于每对等位基因的分离都是、和,故:因此,当由样本

7、均方估计时:(7)(三)群体在一对等位基因时,代自交而得代群体遗传组成为、和,平均数为。故群体的遗传方差为:当推广于对独立等位基因时则为:以上说明,群体的遗传方差中,加性方差,显性方差。将之与代的相应方差相比较,可以看出:。这是由于代比代,纯合体比率提高,杂合体比率减少。随着自交代数的增加,这种趋势将继续发展下去,直至即为止(即,这时的世代群体已成为异质纯合)。对于,则显然有:故由样本均方估计时,即有:(8)如果在试验设计时,将代各植株皆种成一个家系,则还可以追溯中的遗传变异来源:表2F3群体两类

8、遗传方差F2代群体F3代群体基因型频率家系平均数家系内方差001因代基因分离而产生的遗传方差,其方差记作。这是家系平均数间的方差(因的每一家系可追溯为的一个植株和的一粒种子)。由于的和个体在家系的型值仍分别为和,而个体的家系型值则由于分离而成为(表2),故:当推广于对独立基因时则为:2因代基因分离而增加的遗传变异,其方差可记为。它是家系内方差的平均数。由于的和个体在成为家系时,系内遗传方差为0,而在个体在成为家系时,系内遗传方差为(相当于的在的遗传方差),故:在对独立基因时则为:因

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