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《2008―2012奉化市成人麻疹临床分析与病毒基因特征研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、2008-2012奉化市成人麻疹临床分析与病毒基因特征研究摘要:目的:应用分子生物学方法检测奉化市2008-2010年成人感染麻疹病毒,分析麻疹病毒基因特性,了解成人麻疹的发病原因,为麻疹监测和防治提供依据。方法:收集100例成人麻疹患者的咽拭子和血清,应用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹野毒株的核蛋白(N)基因碳末端的456个核苷酸并进行核苷酸序列测定,与基因库中按照病毒各基因型参考株比较并分析毒株变异情况。结果:奉化市成人麻疹临床表现典型,分离到的麻疹病毒均为H1基因型,与H1型参考株的核苷酸同源性为97.1%-98.0%,与中国疫苗株沪191的核
2、苷酸/氨基酸差异为8.0-9.0%/9.8-14.5%。关健词:成人麻疹流行病学病毒基因资料与方法基金项目:宁波市科技局计划项目(200901C4010039),国家“H■■—五”专项(2009ZX10601)一、研究对象2008年1月-2012年6月在奉化市人民医院感染科住院或门诊共诊治的18岁以上成人麻疹患者100例。均经麻疹病毒IgM抗体检测阳性而确诊。在知情同意的情况下,由临床医生调查病人一般情况及病史等,并填写麻疹病毒流行病学调查表,同时收集病人咽拭子、血液标本,于采集后24小时内置冰袋送至实验室。实验室及时对样本作进一步的处理后保存于-
3、70°C冰柜。二、方法2.1、病毒RNA提取取出三个样品(麻疹病毒不同分离株,-80°C凉存,取至上海分子病毒实验室)和一个标准株作阳性对照。麻疹减毒活疫苗沪191(取至上海疾控中心),采用德国QIAGEN公司的RneasyMiniKit,按试剂盒说明书提取麻疹RNA2.2、引物研究所得麻疹病毒核蛋白(Nucleoprotein,N)基因片段扩增引物根据文献涉及,序列如下:MN5,5’-GCCATGGGAGTAGGAGTGGAAC-3(1113-1134);MN6,5’-CTGGCGGCTGTGTGGACCTG-3’(1737-1754)。产物进行
4、1.5%琼脂糖凝电泳,在N基因碳末端的660bp处有一明显阳性带。所有检测至少重复2次。2.3、逆转录-聚合酶链反应(ReverseTranscription-PolymeraseChainReaction,RT-PCR)采用日本TaKaRaonestepRNAPCRkit(AMV)试剂。取8ul麻疹病毒的RNA提取物作为模板,反应条件如下:50°C30min逆转录,94°C2min变性后,PCR循环如下:94°C30s,55°C30s,72°Clmin,循环35周后,72°C延伸lOmin。扩增后产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定。2.4、核苷酸序
5、列测定及分析扩增后产物送上海Invitrogen公司进行序列测定,测序结果的序列拼接、处理分析使用了DNABSTAR软件,其余参比的代表株序列均来自基因库(GenBank)o3结果3.1、入组病例临床资料分析2008年-2012年麻疹流行季节,奉化市人民医院共诊治麻疹抗体IgM阳性确诊的成人麻疹100例。病人年龄集中于18至58岁之间,年龄中位数为36岁。其中男性68例,女性32例。本市人口30例,外来流动人口70例。有30例曾有麻疹疫苗接种史,10例半月内有接种麻疹疫苗(40%),而60%(60/100)患者对是否种接过麻疹疫苗不详。全部病例均有
6、发热,温度37.9°C-40.3°C不等,有88人(88.9%)为38.5°C以上高热。热型为稽留热,体温随皮疹消遐而下降。热程在3-10天之间,其中无合并肺炎这热程在3-7天,合并有支气管肺炎者热程在6-10天,伴随有卡他症状者88例,占88.9%。出现眼结膜充血症状的有96例,占97.0%。出现口腔Koplic斑的有94例。占94.9%。除了发热和斑丘疹外,伴随的其他症状还有恶心、呕吐7例,占7.1%,胸闷、心悸7例,占7.1%,腹痛、腹泻16例,占16.2%。白细胞在2.5-13.6X109/L,彡4X109/L以下的有94例,占94.9%,
7、5例白细胞彡10X109/L,合并有肺炎。肝功能异常者有65例,占65.7%,为轻度异常,ALT彡(谷丙转氨酶)118U/L。心电图提示有ST段改变的有13例,占13.1%,有窦性心动过速的有8例,占8.1%。尿常规异常28例,其中尿蛋白阳性21例,潜血阳性17例,肾功能肌酐、尿素氮升高8例,为轻度异常。3.2、基因亲圆形关系树将所测得的3株麻疹野病毒N基因碳末端的456bp核苷酸序列与Genebank中麻疹病毒各基因型参考株进行比对,明确本研究中分离到的3株麻疹病毒基因型均为H型,与中国流行的基因型一致。有图3可见,3株麻疹病毒均属H1基因型中的
8、Hla亚型,与其他参考株之间存在较大的差异。3.3、序列分析及同源性将3株麻疹病毒N基因碳末端456核苷酸序列与麻疹H1基
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