冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫相互作用转录组研究

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1、冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫相互作用转录组研究中山大学博士后研究工作报告冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫相互作用转录组研究ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｒｅｓｐｏｎｓｅｏｆＯｐｈｉｏｃｏｒｄｙｃｅｐｓｓｉｎｅｎｓｉｓｉｎｔｅｒａｃｔｅｄｗｉｔｈＴｈｉｔａｒｏｄｅｓＩａｒｖａｅ博士后：钟欣合作导师：张古忍教授中山大学生命科学学院广州?中国２０１３年１２月中山大学博士后研究报告目Ｅｊ录ｊｉ２……………………………………………………………………………………………………………………………．Ｉ摘要……………………………………

2、………………………………………………………………………………………．１Ａｂｓｔｒａｃｔ……………………………………………………………………………………………………………………………：！第一章引—————————————————————————————————————————————————————言……………………………………………………………………………………．３１．１冬虫夏草概述……………………………．．．．……………………………………………３１．２冬虫夏草生物学研究概况………………．．．．………………

3、……………………………４１．３转录组测序及寄生生物与宿主生物互作关系研究……………………………………．５１．４本研究的技术路线………………………………………………………………………６第二章冬虫夏草菌及钩蝠蛾昆虫的获取与鉴定………………………………………………８２．１材料与方法………………………………．．．．……………………………………………８２．１．１冬虫夏草菌的分离培养及鉴定…………………………………………………．８２．１．２钩蝠蛾昆虫的饲养及侵染………………………………………………………．８２．１．３样

4、品ＤＮＡ提取方法与步骤……………………………………………………。９２．１．４核糖体基因序列的克隆和测序…………………………………………………．９２．１．５显微观—————————————————————————————————————————————————————察方法……………………………………………………………………ｌｌ２．２结果与讨论………………………………¨¨…………………………………………．．１２２．２．１冬虫夏草菌的分离培养与鉴定…………………………………………………１２２．２．２健康及罹病钩

5、蝠蛾幼虫的获得…………………………………………………１５第三章冬虫夏草菌与钩蝠蛾昆虫转录组测序…………………………………………………１７３．１材料与方法……………………………………………………………………………．．１７３．１．１３．１．２—————————————————————————————————————————————————————３．１．３ＲＮＡ提取方法…………………………………………………………………１７ＲＮＡ质量检测…………………………………………………………………１８Ｉ斟Ａ测序………………

6、……………………………………………………………………………．１８３．１．４基因功能注释……………………………………………………………………２０３．２结果与讨论……………………………………………………………………………．．２２３．２．３中国被毛孢菌丝及钩蝠蛾昆虫ＲＮＡ提取结果及质量检测…………………．２２３ｔ２２测序数据质量检查………………………………………………………………２５３．２３．２３转录组拼接………………………………………………………………………３０４基因注释情况………………………………………………

7、……………………３ｌ第四章冬虫夏草菌侵染寄主昆虫前后转录组分析……………………………………………３７４．１材料与方法……………………………………………………………………………．．３７４．１．１冬虫夏草菌有参基因组的转录组信息分析……………………………………３７—————————————————————————————————————————————————————４．Ｉ．２钩蝠蛾昆虫无参基因组的转录组信息分析……………………………………３８４．１．３基因表达水平定量………………………………………………………

8、………３８４．１．４差异表达分析……………………………………………………………………．３８４．１．５差异表达基因的ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析……………………………………．．３９４．２中国被毛孢侵染寄主昆虫前后有参转录组结果与讨论………………………………３９４．２．１４．２．２Ｒｅａｄｓ与参考基因组比对情况统计…………………………………………．．３９Ｒｅａｄｓ在参考基因组不同区域的分布情况…………………………………．．