应用转录组与蛋白组挖掘冬虫夏草形成的关键位点及野生冬虫夏草与人工冬虫夏草蛋白组差异研究

《应用转录组与蛋白组挖掘冬虫夏草形成的关键位点及野生冬虫夏草与人工冬虫夏草蛋白组差异研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、（药学院）二○一八届硕士研究生学位论文应用转录组与蛋白组挖掘冬虫夏草形成的关键位点及野生冬虫夏草与人工冬虫夏草蛋白组差异研究ApplicationoftranscriptomeandproteomicstoexcavatethekeypointsoftheformationofOphiocordycepsSinensisandthedifferencesbetweentheproteingroupsofwildOphiocordycepsSinensisandartificialOphiocordycepsSinensis研究生姓名：王艺璇指导

2、教师：国锦琳教授学科专业：生药学二○一八年五月学位论文应用转录组与蛋白组挖掘冬虫夏草形成的关键位点及野生冬虫夏草与人工冬虫夏草蛋白组差异研究ApplicationoftranscriptomeandproteomicstoexcavatethekeypointsoftheformationofOphiocordycepsSinensisandthedifferencesbetweentheproteingroupsofwildOphiocordycepsSinensisandartificialOphiocordycepsSinensis硕士生

3、：王艺璇指导教师姓名：国锦琳教授申请学位级别：硕士专业名称：生药学论文提交时间：2018.5论文答辩时间：2018.5二○一八年五月本论文在国家自然科学基金No.81373920、30801522、四川省中医药管理局川产道地药材大品种项目、成都市科技惠民计划支持下完成。摘要冬虫夏草Ophiocordycepssinensis是麦角菌科冬虫夏草菌寄生在蝙蝠蛾科昆虫幼虫上的子座和幼虫尸体的干燥复合体。具有“补肾益肺，止咳化痰”之功效，是一种名贵中药。由于其生理生化的特殊性和复杂性，目前其子实体形成机制研究得并不明确。本研究利用Illumina/So

4、lexaHiSeq2500反转录测序技术对冬虫夏草子实体、菌丝体及小金蝠蛾幼虫转录组进行测序、数据组装、分析，发现冬虫夏草菌丝体、子实体与冬虫夏草具有高同源性，而小金蝠蛾幼虫与其他样品的同源性很低；差异表达分析发现9238个基因在冬虫夏草菌丝体、子实体中均有表达，这相当于72.57％的重合度；经鉴定，1003个基因为DEGs（差异表达基因），KEGG富集分析显示这些DEGs富含核糖体途径；有161个差异表达基因参与丰富了GO术语。子实体中有58个差异表达基因下调，103个差异表达基因上调，表明冬虫夏草蛋白质合成的基本代谢在冬虫夏草菌感染小金蝠蛾

5、幼虫后发生了改变，以及47个基因特异表达；还发现肌动蛋白和微管蛋白相关基因表达的改变可能在子实体发育中起作用。这些结果均与冬虫夏草子实体形成相关。同时利用2-DE（双向电泳）技术对冬虫夏草的发育过程中的三个阶段（菌虫复合体、子座、整体）的蛋白质组进行分析，筛选出5个稳定存在的蛋白质和3个具有显著差异的蛋白质，这8种蛋白质均在子座形成后出现。通过质谱技术进一步鉴定了这8个蛋白质，对其进行功能注释分析(GO、KEGG)后发现，3个具有显著差异的蛋白质斑点1、斑点5、斑点6均与细胞构成相关，其中斑点1参与大量核苷酸结合和酶活性过程，斑点5参与了大量代

6、谢过程和化合物结合过程，斑点6参与了大量代谢过程和细胞生长过程；5个稳定存在的蛋白质中斑点2、斑点3与刺激应答、核苷三磷酸酶结合相关，斑点4与有机氮化合物代谢、离子结合相关，斑点7与生物调节和水解酶活性相关，斑点8与物质运输和转录合成相关。斑点1鉴定为肌动蛋白，GO注释发现该蛋白大量参与了细胞、细胞区域、细胞组分、细胞内、细胞内部分等过程，KEGG通路富集分析发现其活跃的代谢途径为磷脂酰肌醇信号系统、吞噬小体，提示肌动蛋白可能在冬虫夏草的生长发育中其重要作用。1还通过2-DE（双向电泳）技术对野生冬虫夏草整体、菌虫复合体、子座及人工冬虫夏草整体

7、、菌虫复合体、子座的蛋白质组进行对比分析，筛选出野生冬虫夏草特有的蛋白质，验证了课题组前期冬虫夏草正伪品指标性蛋白质，并基于蛋白质层面揭示了野生冬虫夏草与人工培育冬虫夏草间的差异，为后续野生冬虫夏草与人工冬虫夏草的鉴别研究奠定了基础。关键词：冬虫夏草；转录组；蛋白组；指标性蛋白质；发育2成都中医药大学药学院2018届硕士研究生学位论文ABSTRACTOphiocordycepssinensisisadrycomplexofstroma,whichisOphiocordycepssinensis(Beck.)Saccparasiticonlarv

8、aeofgenusHepiausandcorpsesoflarval.Ophiocordycepssinensishastheeffectof“nou