高原型藏山羊sscp标记与产绒性状的关系研究

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1、西南民族大学硕士学位论文题目高原型藏山羊SSCP与产绒性状关系及SSR多态性研究作者代怡婧完成日期2009年5月19日学科门类农学专业动物遗传育种与繁殖研究方向动物遗传资源保护与利用指导教师王杰教授学院（系、部）生命科学与技术学院授予学位日期年月日2本论文由四川省应用基础项目（2008JY0067-1）资助在西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室完成2ThestudyforrelationsbetweenSSCPandcashmereproductiontraitsandSSRPolymor

2、phismofTibetangoatsByDaiYi-JingAdvisor:Prof.JieWangCollegeofLifeScienceandTechnology,SouthwestUniversityforNationalities，Chengdu610041，ChinaMay,20092目录摘要1Abstract3前言1第一章文献综述31.1国内外绒山羊业的发展31.1.1国内外绒山羊品种资源31.1.2国内外绒山羊育种31.1.3高原型藏山羊品种资源51.1.4高原型藏山羊育种51.2侯选基因—毛角

3、蛋白关联蛋白(KAP)61.2.1毛角蛋白关联蛋白(KAP)61.2.2利用KAP基因研究绒山羊产绒性状的进展61.3PCR-SSCP和SSR标记71.3.1PCR-SSCP标记71.3.2SSR标记10第二章高原型藏山羊SSCP与产绒性状关系及SSR多态性研究132.1试验材料和分析方法132.1.1耳组织和血样采集132.1.2主要仪器设备132.1.3主要试剂142.1.4主要分析软件142.1.5缓冲液和常用试剂的配制142.1.6基因组DNA的提取152.1.7DNA纯度及浓度的检测162.1.8SS

4、CP标记的选择与引物合成162.1.9SSR标记的选择与引物合成162.1.10PCR-SSCP反应1822.1.11PCR-SSR扩增192.2数据的统计分析212.2.1等位基因频率及基因型频率212.2.2遗传杂合度（H）212.2.3多态信息含量（PIC）212.2.4各位点基因型产绒性状最小二乘均数（LSM）的数学模型222.2.5遗传方差分析222.2.6预测标记位点与产绒性状间的选择反应222.3结果与分析222.3.1基因组DNA抽提结果222.3.2PCR扩增产物的结果232.3.3聚丙烯酰胺

5、凝胶电泳对PCR扩增产物的分型结果242.3.4PCR-SSCP多态性分析262.3.5高原型藏山羊不同生产水平群体生产性能间的差异性检验272.3.6高原型藏山羊产绒量性状标记基因型的效应分析282.3.7高原型藏山羊绒长度性状标记基因型的效应分析292.3.8高原型藏山羊绒细度性状标记基因型的效应分析292.3.9高原型藏山羊产绒性状位点的遗传方差组分和标记选择反应302.3.10高原型藏山羊SSR遗传多样性分析312.4讨论342.4.1影响SSCP分析的主要因素342.4.2高原型藏山羊产绒性状标记位点

6、和基因型的选择352.4.3SSR遗传多态性分析362.4.4高原型藏山羊多目标性状分子标记存在的问题372.5结论38参考文献39致谢46作者声明47附录482高远型藏山羊SSCP与产绒性状关系及SSR多态性研究摘要本研究以高原型藏山羊为研究对象，选取毛角蛋白辅助蛋白（KAP）基因作为候选基因，研究其作为候选基因来间接选择产绒量、绒长度和绒细度的可行性，同时选用八个SSR标记对它们进行遗传多样性研究，得到结果如下：1通过PCR-SSCP检测，高原型藏山羊中日土白绒藏山羊和白玉黑山羊的KAP位点平均杂合度分别为

7、0.2158和0.2545，平均多态信息含量分别为0.1924和0.2218。进行了日土高原型藏山羊高产和低产群体的SSCP标记与产绒性状相关性的研究，找到可用于育种的优势分子标记和基因型。2在产绒量性状上，KAP6.1位点的BB基因型值与AA基因型值间差异显著（P<0.05）,确定BB基因型为首选标记基因型；KAP6.2位点的AB基因型值与AA基因型差异显著（P<0.05）,确定AB基因型为首选标记基因型；通过计算选择反应，KAP6.1位点作为高原型藏山羊产绒量性状的首选基因。3在绒长度性状上，KAP6.1位

8、点的AA基因型值与BB基因型值间差异显著（P<0.05）,确定AA基因型为首选标记基因型；KAP6.2位点的AA基因型值与BB基因型差异显著（P<0.05）,确定AA基因型为首选标记基因型；通过计算选择反应，KAP6.2位点作为高原型藏山羊绒长度性状的首选基因。4在绒细度性状上，KAP6.2位点的BB基因型值与AA基因型值间差异显著（P<0.05）,确定BB基因型为首选标记基因型；通过