锦鲫clock基因表达量分析中的内参基因稳定性比较

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1、锦鲫Clock基因表达量分析中的内参基因稳定性比较　　摘要为研究锦鲫Clock基因表达量分析中的内参基因稳定性，采用qRTPCR技术进行实时荧光定量分析，并用GeNorm和NormFinder软件对5个内参基因（RPL13，GAPDH，18SrRNA，βactin和RPS29）进行稳定性评估，筛选出不同组织中最适合的内参基因，以准确定量Clock基因的相对表达水平.实验结果表明，5个内参基因中，18SrRNA在锦鲫的肌肉、心脏、肝脏中表达最稳定，βactin在肠中表达最稳定，RPL13在肾中表达最稳定；根据筛选的内参基因定量Clock基因的相对表达水平发现，Clock基因在锦鲫肌肉中相对表

2、达量最高，其次依次是肝脏、肾、肠，心脏中最低.本研究准确定量Clock基因，为锦鲫生物钟节律机制的下一步研究奠定了理论基础.关键词内参基因；qRTPCR；锦鲫；GeNorm程序；NormFinder程序中图分类号S9174文献标识码A文章编号10002537（2016）06003706StabilityComparisonofReferenceGenesonExpression11AnalysisofClockGeneinCarassiusAuratusPENGZhitao1，2，JIANGGuomin3，ZOULi3，LIJinlong3，CHENGXiaofei3，FANGLijuan

3、4，WANGXiaoqing1*，LIULi1，3*（1.CollegeofAnimalScienceandTechnology，HunanAgricultureUniversity，Changsha410128，China；2.AquaticProductsSeedStockStationinHunanProvince，Changsha410153，China；3.FisheriesResearchInstituteofHunanProvince，Changsha410153，China；4.CollegeofBasicMedicine，CentralSouthUniversity，Ch

4、angsha410012，China）AbstractTheaimofthisstudyistocomparethestabilitydifferenceofreferencegenesfromtheexpressionanalysisofClockgeneinCarassiusauratus.ThemRNAexpressionoffivecandidatereferencegenessuchasRPL13，GAPDH18SrRNA，βactin，andRPS29weredetectedbyusingtheqRTPCRmethod，andGeNormandNormFindersoftwar

5、epackages.TheoptimalreferencegenesselectedbyanalyzingandevaluatingtheirmRNAexpressionstabilitywereappliedtoaccuratelyquantifythe11relativeexpressionleveloftheClockgeneindifferenttissuesofCarassiusauratus.Ourresultsshowthatoneofthemoststablereferencegeneswas18SrRNAfromthreetissues，includingmuscle，h

6、eart，andliver，amongthefivereferencegenes，whereasthatfoundinintestineswasβactinandinkidneywasRPL13.Whentheseoptimalreferencegeneswereselectedinfivetissues，wefoundthattherelativeexpressionleveloftheClockgenewasthehighestinthemuscletissue，followedbyliver，kidney，andintestines，andthelowestwasinheart.In

7、summary，thisstudyhasaccuratelyquantifiedtherelativeexpressionlevelsoftheClockgeneintissues，whichshouldserveasthetheoreticalbasisforthefutureinvestigationoftheClockgenerhythmsystem.Keywordsreferencegene；qRTPCR；Car