无标记定量蛋白质组学分析amacr过表达对肝癌细胞生物学

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1、无标记定量蛋白质组学分析AMACR过表达对肝癌细胞生物学行为的影响夏江宝1,2,,邢晓华2,王英超2,*,沈佐君3,*(1.蚌埠医学院医学检验系,蚌埠市,安徽省,233030;2.福建省联合创新重点实验室,福建医科大学孟超肝胆医院,福州市,福建省,350025;3.安徽医科大学附属省立医院,安徽省临床检验中心;*通讯作者及联系方式:王英超,yingchaowang@live.com,沈佐君,shenzuojun@163.com,13515656060,13635251065;第一作者及联系方式:夏江宝,邮箱:1604596301@

2、qq.com,13605695537)摘要目的:研究AMACR过表达对肝癌细胞生物学行为的影响及其分子机制。方法:首先建立AMACR稳定过表达细胞株,然后提取AMACR过表达细胞株的全蛋白,进行无标记定量蛋白质组学研究。最后对鉴定结果进行生物信息学分析和结果验证。结果:应用无标记定量蛋白质组学方法,共筛选出138个差异表达蛋白。这些差异表达蛋白主要参与代谢加工、细胞加工等,证明AMCR的过表达对于肝癌细胞的生物学行为影响巨大。IPA分析发现,这些差异表达蛋白主要参与了ERK1/2信号通路和NF-κB信号通路。同时我们还发现5个潜在

3、的促进癌细胞生长、增殖的因子和一个抗凋亡因子(BCL-2L)。这些蛋白的表达量在AMACR过表达细胞株内均显著上调,而且qRT-PCR验证结果与质谱鉴定结果一致。结论:AMACR的过表达通过调节ERK1/2和NF-κB信号通路以及上调多个促癌因子的表达量等手段改变肝癌细胞的生物学行为。关键词:肝细胞癌,α-甲酰基辅酶A消旋酶,细胞增殖,无标记定量蛋白质组学中图分类号:R735.7Label-FreeQuantitativeProteomicAnalysisoftheeffectofAMACRoverexpressiononbiol

4、ogicalbehaviorsofHepatocellularcarcinomacellsJiangbaoXia1,2,XiaohuaXing2,YingchaoWang2,*,ZuojunShen3,*(1.DepartmentofMedicineLaboratoryofBengbuMedicalCollege,Bengbu,AnhuiProvince,233030;2.TheUnitedInnovationofMengchaoHepatobiliaryTechnologyKeyLaboratoryofFujianProvinc

5、e,MengchaoHepatobiliaryHospitalofFujianMedicalUniversity,Fuzhou,FujianProvince,350025;3.AffiliatedProvincialHospitalofAnhuiMedicalUniversity;*ConrespondingAuthor)AbstractObjective:Inthisstudy,weattemptedtoinvestigatetheeffectofAMACRoverexpressiononthebiologicalbehavio

6、rofHCCcellsusinglabelfreequantitativeproteomicapproch.Methods:Firstly,astablecelllinethatoverexpressedAMACRwasproducedbytransductingengineeredlentiviruscontainingAMACRcompletesequenceintoHepG2cells.Afterwards,thewholeproteinextractedfromtheAMACR-overexpressedcellsandt

7、henormalcultuedcells(control)werecomparativelyquantifiedby2DLC-MS/MS.Followingthat,theidentifiedproteinsweresubsequentlyanalyzedbybioinformaticsandwerevalidatedbyqRT-PCR.Results:Atotalof138differentiallyexpressedproteinswereiedntified.Thesedysregulatedproteinsweremost

8、lyenrichedformetabolicprocessandcellularprocess,whichsuggestedabigchangeatbiologicalbehaviorsoccurredinthehostcellsduetoAMAC

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